Mientras Mugen apuesta en las peleas de escarabajos, un encuentro casual lleva a Jin a enamorarse de una joven prostituta en su primer día de trabajo. ¿Encontrará la manera de librarla del destino impuesto por un marido abusivo?
Un mortífero asesino ha estado eliminando a destacados samuráis con lo que parecen ser poderes sobrenaturales. ¿Conseguirá Mugen sobrevivir al reto letal de un espadachín sediento de venganza entrenado por los monjes Shaolin?
Ginko ayudará a Sui, una niña que ha sido víctima de una rara enfermedad que hace que sienta un terrible dolor cada vez que expone sus ojos incluso a la más ténue de las luces. Ginko sospecha que la causa podría ser un Mushi que ha parasitado sus ojos, y decide salvarle la vista...
Ginko visita a Shinra, un chico que posee el poder de "La Mano de Dios", por el cual es capaz de imbuir vida a todo aquello que dibuja con su mano izquierda. Ginko pretende estudiar a fondo el extraño poder del chico, pero terminará ayudando a su difunta abuela a transformarse por completo en un Mushi para que pueda seguir cuidando del chico.
Tras ser atacados por un Dio enloquecido, Claus, Lavie y Alvi se adentran juntos en el “Grand Stream” con la esperanza de encontrar a la Silvana.
Mientras Guild y las fuerzas aliadas libran su batalla en el interior del “Grand Stream”, Exile comienza a atacar indiscriminadamente a ambas facciones.
Conan y Jimsy viajan de polizones a bordo del Barracuda, pero las payasadas de Jimsy en la cocina alertan a Dyce sobre su presencia. El Capitán decide darles 40 azotes como castigo, pero Jimsy borracho no puede encajar su mitad, lo que obliga a Conan a encajar todo el castigo. El arrepentimiento que siente al descubrir la sobria verdad lleva a Jimsy a cuidar a Conan para que recupere la salud y a asumir la tarea de nivelar el botín de plástico de la isla. El Barracuda se dirige a Industria y Conan recibe el mensaje de Teki de que Lana sigue viva.
Al navegar a través del turbulento Canal del Este, Conan se queda sin agua potable. Entonces, descubre una isla llena de sustento, pero no tarda en chocar con un lugareño llamado Jimsy, dueño de la comida que Conan acaba de comerse. Jimsy destruye el bote de Conan a modo de represalia y los dos luchan, compiten y se insultan hasta descubrir los cimientos de una gran amistad. Más tarde, el Barracuda de Dyce atraca en el puerto y emplea a lugareños para extraer plástico en nombre de Industria. Conan toma prestada una de sus excavadoras y provoca el caos. Impresionado, Jimsy le ofrece su amistad. Con la esperanza de rescatar a Lana, Conan decide viajar de polizón a bordo del Barracuda cuando este regrese a Industria. Jimsy decide que a Conan le vendría bien contar con refuerzos y ambos se dirigen a nado hacia el barco.
Conan ataca el avión de Monsley, pero se cae del ala antes de poder rescatar a Lana. Entonces, regresa a Isla Remanente, donde encuentra a su abuelo moribundo a causa de las heridas. El abuelo le cuenta a Conan la historia de cómo nació y cómo la isla se convirtió en su hogar y luego lo insta a salir al mundo y comenzar una vida propia. Cuando su abuelo fallece, Conan se enfurece contra el destino. Mientras tanto, la tripulación de Monsley llega al Barracuda, donde intercambia pullas con el Capitán Dyce y repara el Falco. De vuelta a Isla Remanente, Conan decide honrar el último deseo de su abuelo de que viera el nuevo mundo e hiciera amigos. Se le ocurre un plan para construir un bote y rescatar a Lana de Industria. Una vez el barco está listo, Conan se despide de su hogar y se hace a la mar.
Veinte años después del Gran Desastre, Conan y su abuelo rescatan a una chica misteriosa llamada Lana cuando esta llega a orillas de Isla Remanente. Conan no tarda en hacerse amigo de Lana y descubre su capacidad para comunicarse telepáticamente con los animales y que existen otras sociedades supervivientes en el mundo. Pronto, llega un grupo de mercenarios encabezados por Monsley que buscan a Lana en nombre del gobierno de Industria. El abuelo se las arregla para mantenerlos a raya con un arma antigua, pero cuando la situación se tuerce, él queda mortalmente herido. Conan se apresura a salvar a Lana, pero la tripulación de Monsley la captura y despega en su hidroavión. Conan salta sobre el ala, usando únicamente su arpón para no caerse.
A falta de una semana para que se abra el agujero, Kuwabara decide asistir a un concierto con sus amigos. Allí se convierten en blanco de Seaman, que les ataca con monstruos líquidos creados al mezclar su propia sangre con agua.
Yusuke se enfrenta a Doctor con la intención de romper su territorio y liberar a sus víctimas. Pero frente a un adversario que no siente dolor ni desfallece, Yusuke se ve obligado a tomar una difícil decisión para salvar a sus amigos.
Al navegar a través del turbulento Canal del Este, Conan se queda sin agua potable. Entonces, descubre una isla llena de sustento, pero no tarda en chocar con un lugareño llamado Jimsy, dueño de la comida que Conan acaba de comerse. Jimsy destruye el bote de Conan a modo de represalia y los dos luchan, compiten y se insultan hasta descubrir los cimientos de una gran amistad. Más tarde, el Barracuda de Dyce atraca en el puerto y emplea a lugareños para extraer plástico en nombre de Industria. Conan toma prestada una de sus excavadoras y provoca el caos. Impresionado, Jimsy le ofrece su amistad. Con la esperanza de rescatar a Lana, Conan decide viajar de polizón a bordo del Barracuda cuando este regrese a Industria. Jimsy decide que a Conan le vendría bien contar con refuerzos y ambos se dirigen a nado hacia el barco.
Conan ataca el avión de Monsley, pero se cae del ala antes de poder rescatar a Lana. Entonces, regresa a Isla Remanente, donde encuentra a su abuelo moribundo a causa de las heridas. El abuelo le cuenta a Conan la historia de cómo nació y cómo la isla se convirtió en su hogar y luego lo insta a salir al mundo y comenzar una vida propia. Cuando su abuelo fallece, Conan se enfurece contra el destino. Mientras tanto, la tripulación de Monsley llega al Barracuda, donde intercambia pullas con el Capitán Dyce y repara el Falco. De vuelta a Isla Remanente, Conan decide honrar el último deseo de su abuelo de que viera el nuevo mundo e hiciera amigos. Se le ocurre un plan para construir un bote y rescatar a Lana de Industria. Una vez el barco está listo, Conan se despide de su hogar y se hace a la mar.
Veinte años después del Gran Desastre, Conan y su abuelo rescatan a una chica misteriosa llamada Lana cuando esta llega a orillas de Isla Remanente. Conan no tarda en hacerse amigo de Lana y descubre su capacidad para comunicarse telepáticamente con los animales y que existen otras sociedades supervivientes en el mundo. Pronto, llega un grupo de mercenarios encabezados por Monsley que buscan a Lana en nombre del gobierno de Industria. El abuelo se las arregla para mantenerlos a raya con un arma antigua, pero cuando la situación se tuerce, él queda mortalmente herido. Conan se apresura a salvar a Lana, pero la tripulación de Monsley la captura y despega en su hidroavión. Conan salta sobre el ala, usando únicamente su arpón para no caerse.
Genkai y Koenma revelan la terrible verdad: alguien está tratando de abrir un agujero entre el Mundo de la Magia y el Mundo de los Humanos. Si el túnel se abre, los demonios lo atravesarán y destruirán el Mundo de los Humanos.
Kurama aprovecha la habilidad de Kaito para rescatar a Kuwabara y a los otros. Tras rescatar a Yusuke y superar los desafíos de Yanagisawa y Kido, sale a la luz la persona que manipulaba entre bambalinas a estos tres jóvenes.
Mediante la extraña habilidad conocida como “Tabú”, Kaito arrebata sucesivamente las almas a Hiei, Kuwabara y Botan. El único que queda, Kurama, se juega el todo por el todo desafiando a Kaito a un juego de palabras.
Yusuke ha sido secuestrado por unos estudiantes con poderes misteriosos. Cuando Kuwabara, Kurama, Hiei y Botan se dirigen a la mansión en la que se encuentra retenido, encuentran a un compañero de clase de Kurama: Yu Kaito.
Al tratar de atravesar el punto de control de Hakone, Mugen, Fuu y Jin son arrestados por culpa de un pasaporte falso. Su única oportunidad de librarse de la condena es resolver el misterio de un bosque infestado de temibles espíritus.