Konohamaru und Boruto können den Butler von ihrer Glaubwürdigkeit überzeugen, woraufhin dieser sie in das Schloss seiner Herrin führt. Mithilfe einer List verschafft sich Boruto Zugang zu Lady Sakuya, trifft dort aber nur noch auf ihren leblosen Körper. Als der Butler seine tote Gebieterin auffindet, liegt der Verdacht nahe, dass der Shinobi für diese Misere verantwortlich ist.
Da sie mehr über die gefährlichen Hashirama Zellen in Erfahrung bringen wollen, müssen Mugino, Sarada, Konohamaru und Boruto in das Stillreich reisen, doch die dortigen Bewohner sind nicht sehr gesprächig. Die Vier müssen tief in die Trickkiste greifen, um dennoch an ein paar Informationen zu gelangen, nur scheint nicht jeder der Einwohner der Gruppe gegenüber wohlgesonnen zu sein.
Seine Mutation verleiht Anato im Kampf außergewöhnliche Kräfte, gegen die jeder Gegenangriff wirkungslos ist. Erst Victors Eingreifen kann den Forscher ruhigstellen. Im Nachhinein wird Boruto und den anderen jedoch klar, dass diese Unterstützung nicht so selbstlos ist, wie sie auf den ersten Blick wirken mag. Schließlich scheint es auch der Firmenchef auf die Hashirama Zellen abgesehen zu haben.
Boruto und seine Freunde werden in das Talreich geschickt, um einen verschollenen Wissenschaftler wiederzufinden. Je länger sie sich mit dem Fall beschäftigen, desto mehr Fragen werden aufgeworfen. So scheint sich der Medizinkonzern, für den der Mann gearbeitet hat, besonders bedeckt zu halten, was das Verschwinden seines Mitarbeiters angeht. Gleichzeitig liegt dem Firmenchef des Unternehmens aber viel daran, sich an der Suche zu beteiligen.
Auf ihrer Reise in das zerstörte Amegakure treffen Sai und Sasuke den einzigen Überlebenden eines grausamen Giftgasanschlags. Sie verbünden sich mit Garashi und hoffen, durch ihn das ehemalige Versteck von Kara zu entdecken. Das blinde Vertrauen erweist sich allerdings schon bald als Fehler, da der Mann den beiden Shinobi eine fürchterliche Falle stellt …
Naruto möchte unbedingt seine dunkle Seite besiegen und möchte von Killerbeat Tipps bekommen. Das ist nicht so einfach, denn der Typ ist etwas seltsam. Deshalb bittet er Motoi, ihm etwas über Oktopus-Opa, wie er Killerbeat mittlerweile nennt, zu erzählen. Der wehrt aber ab. Er könne das nicht mit seinem Gewissen vereinbaren, weil er als Kind zwei Mal versucht habe, Killerbeat etwas anzutun. Nun muss er natürlich auch den Grund sagen: Die Beiden waren als Kinder die besten Freunde, bis Killerbeat vom damaligen Raikage zur Jinchu-Kraft auserwählt wurde. Denn damit veränderte sich sein Leben dramatisch. Seine Aufgabe war es nun, Kontrolle über den Achtschwänzigen zu erlangen, der von Zeit zu Zeit erbarmungslos wütete und Teile von Kumo-Gakure zerstörte. Und bei einem der Versuche, den Achtschwänzigen aufzuhalten und in eine Versiegelungsurne zu stecken, verlor unter anderem Motois Vater sein Leben. Motoi gab natürlich nicht Killerbeat die Schuld, der war ja sein Freund, aber der Jinchu-Kraft, und suchte von da an nach Rache. Er beobachtete Killerbeat immer wieder, und wurde wütend, wenn er ihn lachen sah, aber er scheiterte zwei Mal mit seinem Vorhaben. Killerbeat selbst musste lange ein Spießrutenlaufen ertragen, denn die Dorfbewohner empfanden ihn als Bedrohung. Ihm ging es also auch nicht besser, als Motoi.
Er führt Naruto zum Wasserfall der Wahrheit damit er dort sein wahres ICH kennen lernen kann. Vor allem seine dunkle Seite. Ist Naruto jetzt einen Schritt weiter gekommen?Das Team Yamato geht auf der Paradiesinsel an Land, denn Der Große Kröteneremit hatte ja Naruto prophezeit, dass er dort auf einen Oktopus treffen würde, der ihm helfen könne. Den findet Naruto tatsächlich auch, aber auch viele andere vermeintlich wilde Tiere, die von einem Mann namens Killerbeat, dem bekannten Rapper, gezähmt wurden. Der wurde wiederum von seinem Bruder, dem Raikage, für eine „Auszeit“ auf die Insel verbannt. Für Naruto ist wichtig, dass Killerbeat, wie er, eine Jinchu-Kraft ist, und Bijuu-Geister kontrollieren kann. Deshalb möchte er auch gerne von ihm trainiert werden, auch wenn er ihm etwas merkwürdig vorkommt. Entscheidende Hilfe bekommt Naruto allerdings vom Betreuer des Teams, Motoi, der sie auch beim Anlegen auf der Insel in Empfang nahm.
Boruto freut sich darüber, dass seinem Team ein wichtiger Auftrag zugeteilt wurde. Kurz vor Missionsbeginn erfährt er jedoch, dass die Mujina-Bande Tento verschleppt hat, um den Daimyou zu erpressen. Schweren Herzens lässt der Shinobi daraufhin seine Freunde allein losziehen, während er sich daran macht, seinem Schützling zu helfen. Die Befreiungsaktion ist jedoch alles andere als ungefährlich …
Boruto muss weiterhin als Leibwächter für Tento arbeiten. Der Junge geht dem Ninja allerdings schon bald gewaltig auf den Geist und bittet ihn darum, ihm Shinobi-Kampftechniken beizubringen. Entnervt willigt Boruto ein und beginnt, Tento zu trainieren. Dabei entdeckt er, dass in seinem Schützling mehr steckt als zunächst gedacht.
In Konoha wird hoher Besuch erwartet: Der Daimyou des Feuerreichs hat sich für ein Treffen mit Naruto angekündigt. Der Feudalherr kommt allerdings nicht allein, sondern in Begleitung seines Sohnes Tento. Nachdem der verwöhnte Junge sich im Dorf bereits mit Iwabee angelegt hat, wird Boruto die Aufgabe zugeteilt, dem arroganten Kind als Leibwächter zu dienen. Der Ninja ist davon alles andere als begeistert …
Boruto, Mitsuki und Sarada gelingt es, zusammen mit Kokuri aus dem Gefängnis auszubrechen. Sie werden jedoch von Tsukiyo eingeholt, der das Team angreift. Um das Leben ihres Freundes zu retten, müssen die Shinobi all ihre Kräfte aufbringen, denn obwohl sie in der Überzahl sind, ist Tsukiyo ein gefährlicher Gegner – mit seinem mächtigen Mondschatten-Jutsu macht er den Ninjas schwer zu schaffen.
Während Boruto, Mitsuki und Kokuri ihren Ausbruchsplan in die Tat umsetzen, werden sie in den Tunneln unter dem Gefängnis von einem gigantischen Monster attackiert. Das ist allerdings nicht das einzige Problem, mit dem die Shinobi zu kämpfen haben, da Oberaufseher Benga ihre Pläne durchschaut hat und ihnen nachsetzt. Sarada kämpft währenddessen in einem überfluteten Teil der Burg um ihr Überleben – und bekommt dabei Hilfe von unerwarteter Seite.
Die Ninjas hecken einen Plan aus, um zusammen mit Kokuri aus dem Gefängnis auszubrechen, bevor ihr Freund in den anderen Zellenblock verlegt wird. Dafür müssen sie jedoch zunächst das Jutsu brechen, das ihr Freund bei seiner Einlieferung ins Schloss erhalten hat – und das stellt sich als gar nicht so einfach heraus. Als dann auch noch Kedama die Ausbruchspläne der Shinobi mitbekommt, wird die Sache noch komplizierter.
Boruto und Mitsuki versuchen in Erfahrung zu bringen, wo Kokuri das Geld von der Mujina-Bande verstaut hat. Da dieser sich weigert seinen Mithäftlingen zu verraten, wo sich das Diebesgut befindet, greifen die Ninjas mit Saradas Hilfe zu einer List. Währenddessen will auch Oberaufseher Benga mehr über Kokuris Geheimnis herausfinden – und schreckt dabei vor Gewalt nicht zurück.
Oberaufseher Benga ordnet einen Lockdown des gesamten Gefängnisses an, bis der Dieb der hölzernen Karte – und damit auch Kokuris Angreifer – gefunden wurde. Boruto und Mitsuki kombinieren, dass sich der Täter mit ihnen in einer Zelle befinden muss und machen sich daran, alles zu durchsuchen. Allerdings ist nicht jeder ihrer Mithäftlinge von dem Plan begeistert und so mancher verhält sich äußert verdächtig …
Nachdem Kokuri von einem mysteriösen Mann angegriffen wurde, wollen Boruto und Mitsuki besser für seine Sicherheit sorgen. Mit Saradas Hilfe versuchen sie, ihren Schützling in die eigene Zelle verlegen zu lassen, doch Oberaufseher Benga stellt sich quer. Boruto möchte deshalb in Erfahrung bringen, wie er gegen ihn vorgehen kann – für diese Information muss er jedoch erst einmal einen gefährlichen Test der Willensstärke bestehen.
Boruto und Mitsuki werden mit einer neuen Mission betraut: Sie sollen im Shinobi-Gefängnis Hozuki einen Gefangenen beschützen, der wichtige Informationen über eine kriminelle Bande besitzt. Die beiden Ninjas geben sich deshalb als Verbrecher aus und werden ebenfalls hinter Gitter gesteckt. Dort müssen sie nicht nur ihre Aufgabe ausführen, sondern bekommen es auch mit ihren Mitgefangenen und fiesen Aufsehern zu tun.
Inojin möchte lernen, sein Jutsu der Geistesübertragung besser einzusetzen, nachdem es ihm in einer gefährlichen Situation misslungen ist. Chocho und seine Eltern Ino und Sai bieten ihm dafür ihre Hilfe an. Als Inojin es während des Übens allerdings wieder nicht schafft, das Jutsu korrekt auszuführen, endet das Training in einer dramatischen Situation …
Enko von Team 40 gelingt es nicht, ihre Wut zu kontrollieren. Immer wieder rastet sie aus und bringt dabei nicht nur sich selbst, sondern auch ihre Freunde Doshu und Tsuru in Gefahr. Die beiden wollen ihr beistehen, müssen aber erst einmal lernen, mit der eigenen Angst vor ihrer Teamkollegin umzugehen. Boruto und seine Freunde wollen sie dabei unterstützen, allerdings wird Enko währenddessen eine neue Aufsichtsperson zugeteilt – und diese ist ein berüchtigter Folterer.
Hiashis Geburtstag steht an und seine Familie möchte eine große Feier für ihn veranstalten. Doch Boruto ist sich unsicher, was er seinem Großvater zu diesem Ehrentag schenken soll. Hilfesuchend wendet er sich an seine Freunde … (