그는 신장 질환을 앓고 있어서 6시간마다 약을 투여하지 않으면 목숨이 위태로워진다고 한다.엎친 데 덮친 격으로 몸값을 들고 가던 범인이 사고로 사망을 한다.금속 가공 회사의 사장, 도모토 쇼자부로가 납치당했다.바로 위급 상황이 오는 건 아니지만, 8시간이 넘어가면 목숨이 위험하다.쇼자부로가 마지막으로 주사를 맞은 건 오전 9시.8시간이 되기까지 앞으로 1시간 반밖에 남지 않았는데...
피의자로 지목된 사람은 미나미다 유이치. 그도 이미 체포된 상황이었지만, 문제가 하나 있었다.키타무라의 가슴께를 찌른 칼의 각도가 대각선 아래였던 것이다.코난은 란과 장을 보러 가는 길에 한 공장 앞에서 수사 중인 타카기 형사와 만난다.즉, 피해자보다 20cm나 큰 미나미다의 범행으로 볼 수 없는 것이었는데...타카기는 살인 사건을 조사 중이었는데 공장의 사장, 키타무라 카츠고로가 그 피해자였다.
고층 주택 23층에서 회사원 나카모토 히로토시가 살해당했다. 코난과 어린이 탐정단이 목격한 수상한 남자는 피해자의 동료인 카토 아키라로 판명 났다. 그러나 카토는 치바 형사의 집에서 얹혀살고 있었고 범행 시각 당시 치바와 함께 TV를 봤다고 진술한다. 하지만 침실, 부엌, 그리고 현관에 걸린 시계를 살펴본 코난은 범인이 카토라고 확신하는데...
마츠모토 관리관은 메구레에게 돗토리현경의 요청으로 경시청 형사를 파견해야 한다고 알린다. 누가 적임자일지 고민하던 중 마츠모토 관리관은 타카기를 추천해야겠다고 말한다. 소식을 전해 들은 타카기는 사토 형사와 헤어지고 싶지 않은 마음에 착잡하다. 그때 살해 사건 신고를 받고 출동한 사토, 타카기, 쵸. 셋은 친구 집에 얹혀살고 있다는 살인 용의자의 집으로 향했다. 하지만 문을 열고 나온 사람은 용의자란 남성과 치바 형사였는데...
방파제 낚시를 하러 간 코난과 어린이 탐정단. 흩어져서 낚시를 하다가 돌아갈 때쯤, 에지리 후토시가 독 중독으로 쓰러져 아가사 박사와 이다가 병원으로 옮긴다. 아가사 박사가 전화로 피해자의 왼쪽 손목에 무언가가 걸렸던 상처가 있고 소맷부리에는 풀이 묻어 있다는 소식을 전한다. 이에 코난은 살해 방법을 간파하여 부둣가에 남아 있던 시라네와 카네타니 두 사람 중에 있는 범인을 밝혀내는데...
방파제 낚시를 하러 간 코난과 어린이 탐정단은 배에서 시라네 키리코, 카네타니 미네토, 에지리 후토시와 만난다. 방파제에 도착한 후, 선장 이다 이와오는 세 시간 뒤에 데리러 오겠다고 하고는 다시 돌아갔다. 세 시간이 지나고 배가 다시 온 그때, 낚싯대에 입질이 왔는데도 미동조차 하지 않는 에지리. 결국 낚싯대는 바다에 빠지고 이를 이상하게 여긴 이다가 달려가 보지만 이미 사망한 상태였는데...
코고로가 의뢰를 받고 미행하던 히토미 쇼이치로가 베이카 호텔에서 추락사한다. 그와 같은 시각, 쇼이치로의 쌍둥이 동생인 타케히코도 자택에서 누군가에게 살해당한 채 발견된다. 우연이라고 볼 수밖에 없는 사건에 코난은 작위적인 느낌을 받는다. 한편, 타니자키라는 또 다른 남성이 사건과 관련이 있다는 것을 안 코난은 사건 경위를 곱씹다가 마침내 진상을 알아내는데...
의뢰인의 요청으로 히토미 쇼이치로를 미행 중이던 모리 코고로. 히토미가 미나미자토 카오루라는 여성을 덮치려다 실패하고 도주하던 도중에 베이카 호텔에서 떨어져 추락사한다. 그와 같은 시간, 쇼이치로의 쌍둥이 동생인 타케히코도 자택에서 숨진 채 발견된다. 경찰은 타케히코의 죽음을 강도에 의한 살인이며 두 사건은 관련 없는 우연한 사건으로 보지만, 코난은 동시에 발생한 사건이 작위적이라 느끼는데...
아파트 단지 내의 화단에서 노파가 시신으로 발견된다. '대형 폐기물' 스티커가 붙어 있는 냉장고 아래로 한쪽 손을 넣은 채로 사망하였다. 주변에는 산산조각이 난 한 화분이 있고 하늘에는 까마귀들이 날고 있다. 사건을 조사하러 출동한 경찰은 정황상 베란다에 매달려 있던 화분이 까마귀들이 장난치다가 떨어져서 사망했다고 하지만, 코난은 어딘가 미심쩍은데...
코난이 란에게 부탁을 받고 테이탄 고등학교의 유령 소동을 조사하던 중, 운동장에 갑자기 2년 전에 사망한 호사카 히데아키의 책상이 나타난다. 코난은 입구에서 교문까지 향하는 운동장에 발자국이 남아 있지 않다는 점에서 유령 소동의 범인이 아직 교내에 있다고 생각하고 있다. 마침내 범인을 특정한 코난은 마취 침을 쏴 소노코를 재우고 범인이 쓴 트릭과 사건의 진상을 밝히는데...
란의 부탁으로 테이탄 고등학교의 유령 소동을 조사하러 온 코난. 호사카와 관련한 괴담을 조사하던 중, 운동장에 난데없이 2년 전에 사망한 호사카 히데유키의 책상이 나타난다. 거기다 책상 위에는 원한의 글귀가 적혀 있고 비가 내려 질척거리는 땅에는 책상을 옮긴 사람의 발자국이 없다. 그때 갑자기 코난 일행의 이야기를 엿듣던 미술부 부원의 모노베 마사오가 호사카의 저주라고 소리치며 공포에 떠는데...
겐타가 코난, 미츠히코, 아유미에게 보여 주고 싶은 게 있다며 함께 펫 숍으로 향했으나 가게가 닫혀 있었다. 그런데 셔터는 잠겨 있지 않았다. 그때 ‘니노미야'라는 청년이 나타나 셔터를 열고 같이 안으로 들어가게 된다. 가게를 둘러보던 중 장수풍뎅이 한 마리가 기어 나온다. 이를 의심스럽게 여겨 방으로 들어간 코난이 거기서 남자의 시신을 발견하는데...
트로피컬 마린 랜드에서의 연인다운 시간을 보내야 할 데이트가 마약 거래 수사로 바뀌고 만 타카기 형사와 사토 형사. 놀이공원 폐장을 앞둔 5시 반, 마침내 코난 일행은 운반책을 발견한다. 운반책과 마약상이 접촉하는 순간을 노리던 사토와 타카기. 사토는 타카기에게 코난과 어린이 탐정단을 맡기고 마약 밀매상 야쿠라 아사키치를 체포하기 위해 접근하지만, 야쿠라는 잽싸게 사토에게 권총을 겨누고 한 발의 총성이 들리는데...
트로피컬 마린 랜드에서 데이트 중인 사토 형사와 타카기 형사. 타카기 형사는 몰래 반지를 가방에 넣어 와서 사토 형사한테 고백하려 한다. 한편, 시라토리 경부를 비롯한 본청 형사들은 트로피컬 마린 랜드에 마약 거래 잠복근무 차 데이트하는 사토와 타카기를 방해한다. 사토와 타카기는 데이트하다가 우연히 코난 일행을 만나 같이 다닌다. 놀이공원을 만끽하던 타카기는 어느새 자기 가방이 다른 사람의 것과 바뀌었다는 걸 알게 되는데...
란과 코난은 상점가에서 장을 보다가 우연히 귀가하던 니시무라 사치코와 만난다. 니시무라는 일전에 란이 학생 수첩을 잃어버렸을 때 수첩을 주워서 가져다준 사람이다. 반가움도 잠시, 다음날 니시무라가 싸늘한 주검으로 발견된다. 탐문 수사로 니시무라가 살해당하기 전날 남자 친구로 추정되는 인물과 같이 있었다는 게 밝혀지고 경찰들도 정황상 남자 친구가 범인이라고 확신하고 있는데...
괴도 키드가 많은 사람들 앞에서 공중을 걷는 모습을 선보이자, 코난과 나카모리 경부는 서둘러 주변을 살폈지만 아무런 속임수도 발견하지 못한다. 다음 날 코난 일행은 옥상에서 키드가 나타나길 기다리다가 그가 남긴 듯한 흔적을 발견한다. 그 뒤에 코난은 나카모리 경부에게 또 다른 단서까지 얻으며 점점 진실과 가까워지는데...
코난 일행은 우연히 귀국한 지로키치와 마주쳤는데, 그는 괴도 키드가 관심을 보일 만한 보석을 구하기 위해 전 세계를 돌고 왔다고 한다. 지로키치는 구해 온 대양의 기적 ‘블루 원더'를 걸고 괴도 키드에게 도전장을 던지고, 괴도 키드도 그 도전을 받아들인다. 키드가 미리 살펴보러 오겠다고 한 날이 되자 코난은 걸어서 오겠다는 예고를 떠올리며 그를 기다린다. 그런데 괴도 키드는 놀랍게도 땅이 아니라 공중에 나타났고, 심지어 공중을 걷기도 하는데...
사건을 수사하던 경찰은 어젯밤 후나키와 언쟁을 벌였다는 마스부치를 찾아가 사정을 물었다. 한편, 코난은 후나키의 시신이 있던 장소를 조사하다가 미츠히코와 겐타가 배낚시를 하다가 주워 올린 것을 보고 범인과 살해 방법을 알아차린다. 배스 낚시 대회에서 우승한 마스부치, 준우승한 아유카와. 코난은 소노코를 잠재워 박수갈채를 받으며 퇴장하려는 두 사람을 불러 세우고 추리 쇼를 시작하는데...
소노코의 초대로 배스 낚시 대회에 참가하게 된 란과 코난, 그리고 어린이 탐정단은 그곳에서 우승 후보인 아유카와 사오리와 마스부치 타쿠야와 알게 된다. 대회 첫날 밤, 코난은 우연히 자유 기고가인 후나키 토시히코와 마스부치가 큰 소리로 언쟁을 벌이는 모습을 지켜보다 자리를 뜬다. 대회 둘째 날, 란과 소노코는 전날에 한 마리도 못 잡은 코난과 어린이 탐정단을 보러 가는 도중에 쓰러져 죽어 있는 후나키를 발견하게 되는데...
코난과 어린이 탐정단은 유령으로 나타난 '오토자와 마미'에 대해 조사하다가 민박집의 주인장, 나가쿠라 이와오가 칼에 찔리는 모습을 목격한다. 나가쿠라를 해치려고 한 중요 참고인으로 품행이 불량한 카와지가 경찰에 연행된다. 한편, 진범이 따로 있다고 생각한 코난은 열흘 전에 나가쿠라의 집과 오토자와의 집을 통째로 바꿔 옮겼다는 얘기를 듣는다. 이에 코난은 현재는 폐가가 된 오토자와의 집으로 향하는데...