Boruto und seine Freunde sind passionierte Sammler der Ultra-Shinobi-Karten. Diese sind so beliebt, dass die erste Auflage innerhalb kürzester Zeit vergriffen war. Doch nun gibt es Nachschub und das lassen sich Boruto, Shikadei und Metal natürlich nicht entgehen.
Enko von Team 40 gelingt es nicht, ihre Wut zu kontrollieren. Immer wieder rastet sie aus und bringt dabei nicht nur sich selbst, sondern auch ihre Freunde Doshu und Tsuru in Gefahr. Die beiden wollen ihr beistehen, müssen aber erst einmal lernen, mit der eigenen Angst vor ihrer Teamkollegin umzugehen. Boruto und seine Freunde wollen sie dabei unterstützen, allerdings wird Enko währenddessen eine neue Aufsichtsperson zugeteilt – und diese ist ein berüchtigter Folterer.
Hiashis Geburtstag steht an und seine Familie möchte eine große Feier für ihn veranstalten. Doch Boruto ist sich unsicher, was er seinem Großvater zu diesem Ehrentag schenken soll. Hilfesuchend wendet er sich an seine Freunde … (
Sumire wird in ein Forschungsteam versetzt, worüber ihre Teamkollegen untröstlich sind. Doch es gibt bereits Ersatz für das Mädchen – eine Samurai aus dem Eisenreich. Ihr Zusammentreffen mit den Shinobi verläuft jedoch nicht gerade rund und es kommt schon bald zu Konflikten.
Nach dem Kampf gegen Urashiki können Boruto und Sasuke endlich wieder in ihre eigene Zeit zurückreisen. Doch zuvor muss die Erinnerung an die beiden erst aus den Gedächtnissen der Dorfbewohner gelöscht werden.
Boruto, Naruto und Jiraiya kämpfen weiterhin gegen Urashiki und stehen kurz vor dem Sieg. Doch dann greift der Otsutsuki plötzlich zu einem unerwarteten Mittel und verwandelt sich in ein noch viel stärkeres Wesen. Zusammen müssen die Ninjas nun all ihre Kräfte aufbringen, um den Feind endgültig zu stoppen.
Boruto, Naruto, Jiraiya und Sasuke stehen Urashiki ein weiteres Mal im Kampf gegenüber. Und sie scheinen dem Otsutsuki weit unterlegen zu sein, denn dieser behauptet, in die Zukunft blicken und so jeden ihrer Schritte vorhersehen zu können. Um dem Bösewicht vorerst zu entkommen, opfert sich Sasuke für sein Team.
Das Vater-Sohn-Training geht weiter und Boruto möchte noch mehr über die Bewohner Konohas erfahren – vor allem darüber, was mit dem Vergangenheits-Sasuke passiert ist. Währenddessen beginnt Jiraiya an der Geschichte von Boruto und Sasuke aus der Zukunft zu zweifeln und stellt den älteren Ninja zur Rede. Gemeinsam überlegen sie sich schließlich einen Schlachtplan für den nächsten Angriff von Urashiki.
Nach Urashikis Angriff beschließt Jiraiya, Boruto und Naruto gemeinsam zu trainieren. Die beiden sollen lernen, ihre Chakras miteinander zu synchronisieren. Doch Boruto hat Angst vor der Macht des Neunschwänzigen.
Urashiki taucht plötzlich in der Vergangenheit auf und überrascht Boruto, Naruto und Sasuke. Der Otsutsuki will Naruto nun endlich das Chakra des Neunschwänzigen entreißen. Als der Versuch jedoch scheitert, entführt er den jungen Ninja kurzerhand …
Boruto freundet sich in der Vergangenheit mit seinem jungen Vater an und die beiden treffen in der Stadt Konoha auf allerlei bekannte Gesichter. Als die Genin dann vom Hokage einen Auftrag bekommen, hilft auch Boruto mit aus. So kann er aus nächster Nähe beobachten, wie Naruto und seine Freunde als Kinder waren.
Durch das Relikt der Otsutsuki sind Boruto und Sasuke im Konoha der Vergangenheit gelandet. Sie finden schon bald heraus, dass Urashiki Naruto als Kind angreifen will, um an das Fuchs-Chakra zu gelangen. Um dies zu verhindern, muss Boruto unbedingt seinen jungen Vater aufspüren …
Naruto bereitet sein Dorf auf einen potenziellen Angriff von Urashiki vor. Dieser hat es auf das Chakra des Monsterfuchses abgesehen, der in Naruto steckt. Während sich alle zum Kampf bereitmachen, muss Boruto zurückbleiben. Zusammen mit Sasuke heckt er deshalb einen alternativen Plan aus, um den Otsutsuki zu stoppen.
Boruto stellt Nachforschungen zu Meister Jiraiya an, der seinen Vater einst unterrichtet hat. Der mächtige Sannin war nicht nur ein hervorragender Kämpfer, sondern auch erfolgreicher Autor. Sein Buch „Flirt-Taktiken“ möchte Boruto nun unbedingt lesen. Doch Naruto ist strikt dagegen, weswegen sich sein Sohn zusammen mit Sarada heimlich auf die Suche nach dem alten Schmöker begibt.
Die Ninja aus Konoha sind bereit, in den Krieg zu ziehen. Und auch Konohamaru würde sich ihnen allzu gerne anschließen. Da er glaubt, beim letzten Angriff auf das Dorf Pain alleine ausgeschaltet zu haben, sieht er sich als vollendeten Ninja, für den es eine Schande wäre, nicht dabei zu sein, wenn die Feinde niedergeschlagen werden. Doch niemand im Dorf scheint seine Hilfe beanspruchen zu wollen. Und auch seine besten Freunde Moegi und Udon sind skeptisch, dass die Erwachsenen sie an die Front lassen würden. Und so gründen die drei eine Zeitung, die von den Kriegsvorbereitungen berichtet. Konohamaru jedoch gibt nicht auf. Er stellt sich Temari, der Schwester des Kazekage aus dem Nachbarreich zum Kampf, welches früher mit Konoha befeindet war. Doch mittlerweile sind die beiden Dörfer verbündet. Nur Konohamaru scheint davon nichts zu wissen und muss von Shikaku gerettet werden, bevor Temari ihn ernsthaft verletzt. Nur langsam kapiert Konohamaru, dass es auch andere Mittel und Wege gibt, dem Dorf zu helfen als mit der Waffe in der Hand. Erst am Ende versteht er das Rätsel, das Shikaku ihm gestellt hat, indem er fragte, welchem König Konohamaru denn dienen wolle Die Gemeinschaft des Dorfes ist der König, und ihm hat man sich zu unterstellen!
Die Schiffcrew hat endlich wieder einmal Land unter den Füßen und würde den Weg ins Blitz-Reich am liebsten über Land zurücklegen. Das geht nur leider nicht, denn sie befinden sich auf dem Territorium des Wasser-Reiches mit vielen kleinen Inseln. Was die Situation aber gefährlich macht, ist die Tatsache, dass sich in dieser Gegend ein Betrüger herumtreiben soll. Er heißt Banna, und auf diesen stoßen Yamato & Co bald. Makaber ist, dass sich dieser Mann als Naruto Uzumaki ausgibt, dem Retter von Konaha. Er trägt sogar das Stirnband von Konoha. Es kommt zum unvermeidlichen Kampf, den Naruto für sich entscheidet. Plötzlich taucht ein Mann namens Igih auf, der zunächst behauptet, er sei Polizist und hinter dem Räuber her, aber schnell stellt sich heraus, dass sich die Beiden kennen, ja sogar schon lange befreundet sind. Das gilt es zu überprüfen. Während sich das Team Yamato entfernt, wird Banna von Räubern entführt. Nun machen sie sich mit Igih auf die Suche, um den Entführten zu befreien. Das gelingt ihnen im letzten Moment, und es zeigt sich, dass Banna und Igih wirklich Freunde sind.
Konohamaru kommt in einem Dorf einer Frau namens Remon zu Hilfe – diese wird von seltsamen Männern verfolgt und belästigt. Damit sie die Besichtigung des Ortes weiter fortsetzen kann, beschließen Boruto und Konohamaru sie zu beschützen.
Die Mitglieder des Team 25 sind durch mehrere vermasselte Missionen in Ungnade gefallen. Nun sollen sie in einer Postfiliale aushelfen, doch auch dabei bricht schnell Chaos aus. Als sie einen Überraschungsbesuch bekommen, müssen sich Hoki, Hako und Renga endlich zusammenreißen, um erfolgreich zusammenzuarbeiten.
Boruto und seine Freunde sind passionierte Sammler der Ultra-Shinobi-Karten. Diese sind so beliebt, dass die erste Auflage innerhalb kürzester Zeit vergriffen war. Doch nun gibt es Nachschub und das lassen sich Boruto, Shikadei und Metal natürlich nicht entgehen.
Shikadai wurde inzwischen zum Chunin befördert und bekommt seinen ersten Auftrag. Zusammen mit Boruto, Iwabee und Wasabi, soll er eine seltene Blume finden, die nur alle paar Jahre einmal blüht. Das Team muss sich allerdings beeilen, denn sie sind nicht die einzigen, die hinter der außergewöhnlichen Pflanze her sind …