여행 도중, 전설의 포켓몬, 썬더를 기리는 축제가 열리는 우레마을을 방문하기로 한 지우와 친구들. 그러나 갑자기 큰 천둥이 울린다! 허둥지둥 근처 동굴로 몸을 피한 지우와 친구들은 그곳에서 부상 당한 구급대원과 만난다. 부상을 입은 구급대원을 대신하여, 마을 병원의 아이들에게 약을 전달하기로 한 지우. 그러나 동굴을 빠져나오니 화가 난 썬더의 모습이!?
세레나는 마지막 하나의 프린세스 키를 얻기 위해, 지우와 친구들과 함께 루키클래스가 열리는 플레이시티에 도착한다. 그러나 이 대회에는, 플레이시티의 명문가 출신 유력 퍼포머, 아멜리아도 참가한다. 강력한 라이벌의 등장에 불안한 듯한 세레나. 그리고 대회장에는, 전 칼로스퀸의 유명 프로듀서, 아젤리아가 나타나는데…?
숲에서 미아가 되어버린 지우와 친구들. 겨우 다다른 곳은 유령이 나온다는 소문이 있는 “무서운 집”이었다!? 갈팡질팡하는 친구들 앞에 집 주인이라고 하는 노인 코르가 나타나 집에 들리지 않겠냐고 제안해왔다. 때마침 비가 오기 시작해서 코르의 호의를 받아들이기로 한 지우와 친구들. 연발하는 괴기현상. 사라지는 친구들. 무서운 집의 진실은!?
로켓단과의 배틀 도중, 갑자기 부란다에게 습격을 받은 지우와 친구들. 혼란 속에서 친구들과 떨어진 유리카가 정신을 차리고 보니, 옆에 있는 건 무려 로켓단의 나옹?! 게다가 서로의 몸에는 덩굴이 감겨있어서 떨어질 수 없게 되고, 싫어도 함께 행동을 해야 하는 상황이 되었다. 닥쳐오는 많은 트러블. 과연 유리카와 나옹은 무사히 친구들이 있는 곳 까지 갈 수 있을까?!
미끄래곤의 고향인 습지대에 머무는 지우와 친구들. 지우와 친구들은 습지대에 사는 포켓몬 친구들 간의 싸움에 속상해하면서도, 인간이 포켓몬끼리의 관계에 끼어드는 것에 대해 고민한다. 그날 밤 갑자기 플라제스가 이끄는 군단이 피카츄와 포켓몬들을 납치해 간다! 구출에 나선 지우와 친구들. 혼란 속에 꿈틀거리는 수상한 그림자의 정체는…?
여행 도중 어느 습지대에 들른 지우와 친구들. 그런데 이 습지대는 미끄래곤의 고향이었다!! 미끄래곤은 고향 친구들과 다시 만나 기뻐하지만, 어딘가가 조금 이상한데... 그곳에 습지대의 지배자 플라제스가 이끄는 군단이 공격해온 것이다!? 친구들을 지키기 위해, 고향의 평화를 지키기 위해, 미끄래곤이 나선다!!
플라타느 연구소에 들른 지우와 친구들. 플라타느박사가 발견한 메가스톤이 한카리아스나이트로 밝혀져서 한껏 들떠있었는데... 그런데 갑자기 로켓단이 나타나 키스톤, 메가스톤, 그리고 한카리아스를 빼앗아 간다! 로켓단의 뒤를 쫓는 지우와 친구들. 그런데 로켓단은 한카리아스를 메가진화 시켜 공격하려고 하는데!?
검은 레쿠쟈에 대한 정보를 얻기 위해 예술가인 콜사를 찾아온 리코와 로드. 두 사람은 그곳에서 챔피언 랭크 트레이너 네모와 만나게 된다. 네모와 함께 콜사를 방문하지만 콜사는 슬럼프에 빠져 체육관도 폐쇄 중인 상태였는데…
검은 레쿠쟈의 단서를 찾기 위해 올리르바의 숲을 찾아갔지만 그 숲은 얼마 전에 일어난 산불로 인해 황폐해져 있었다. 리코 일행은 바싹 마른 우파를 만나 치료해 주려고 하지만 숲의 포켓몬들은 그것을 오해하고 공격해 오는데…
리코와 로드는 라이징 볼트태클즈의 도움을 받아 숲을 살리기 위해 노력한다. 그 모습을 보고 있던 올리르바는 어떤 이변을 일으키고 리코의 펜던트는 다시 빛나기 시작한다. 리코는 펜던트의 비밀을 알기 위해 할머니를 만나기로 결심하고 프리드 일행은 그에 동행하기로 하는데…
프리드가 아메시오의 시선을 끄는 동안 리코와 로드는 익스플로러즈로부터 도망치려 한다. 하지만 함베르가 이끌고 온 지원군과 맞닥뜨리게 되고, 위험천만한 상황에 빠지게 되는데…
플레어단의 습격을 겨우 물리친 지우와 친구들. 유리카는 배틀 도중에 행방불명이 된 “아이”에 대한 걱정으로 안절부절인 듯한데… 다 함께 끝의 동굴 주변을 찾아보지만, 실수로 독개굴을 화나게 하여, 파르빗이 부상을 당했다! 게다가 파르빗의 부상을 자신의 잘못이라 생각한 유리카가 보여준 행동은!?
이설시티로 향하는 도중, 끝의 동굴에 들르게 된 지우와 친구들. 동굴로 들어가서보니 말랑이가 어디론가 사라져버렸다! 당황하여 말랑이를 찾는 지우와 친구들. 동굴 내부에서 말랑이를 찾아다녔지만, 말랑이를 아예 잃어버린 것 같다!! 그때 갑자기, 플레어단이 나타나 말랑이가 사라진 주변을 공격하기 시작하는데…
세레나가 또다시 트라이포카론에 도전한다! 이번 무대부터는 이브이도 참가하여, 연기실력도 늘었는데! 하지만 정작 주인공인 이브이는 첫 무대를 앞두고 조금은 긴장한 듯한 모습. 세레나는 테르나, 판짱과 함께 이브이를 격려해주어, 팀원들의 결속력은 한 층 더 단단해지는데... 그리고 무대에 오르는 날, 이브이는 과연 첫 무대에서 첫 승리를 할 수 있을까!?
납치된 두령을 구하기 위해 의문의 닌자군단을 쫓는 지우와 삼평 일행. 적의 보스인 영우는 삼평의 형인 일평과 일대일 승부를 하고자 지우 일행 앞에 자객을 보내온다. 치열한 배틀을 하던 중, 지우의 개굴반장에게 변화가… 그리고 지우의 몸에도 신기한 현상이…!!
이설시티를 향해 여행을 계속하고 있는 지우와 침구들은 삼평과 개굴닌자를 다시 만났다.삼평은 닌자마을에서 열리는 축제에 초대한다고 했다. 처음으로 방문하는 닌자마을에서 삼평의 형인 일평과 이평, 그리고 닌자마을 사람들을 만난 지우 일행. 그런데 갑자기, 의문의 닌자군단이 닌자마을을 습격하여 닌자마을의 두령이 납치 당하는데…
여행 도중, 칼로스발전소 근처를 지나가던 일행은 발전소에 들러 보기로 한다. 하지만 발전소에 다가가자 포켓몬들에게 이변이 일어나는데! 실은 로켓단이 발전소를 점령하고 전기타입 포켓몬들을 조종하고 있었던 것이다! 과연 지우와 친구들은 포켓몬들을 구해낼 수 있을까? 한편 시트론은 무언가로 고민하고 있는 것 같은데…?
지우와 친구들은 여행 도중 만난 황야에서 상처 입은 피그점프를 도와준다. 피그점프는 황야에 있는 오아시스에서 평화롭게 살고 있었지만 홀연히 나타난 피그킹에게 괴롭힘을 당해 도망쳤다고 한다. 지우와 친구들은 피그점프를 도와주려고 하지만 배후에 있던 로켓단의 덫에 걸려들어 곤경을 겪게 되고, 한 편 위기에서 빠져 나온 데덴네와 미끄메라는 피그킹에게 맞서게 된다! 그 때, 미끄메라의 모습이!?
오늘은 드디어 세레나가 처음 트라이포카론에 도전하는 날. 세레나는 긴장한 기색이었지만, 사나와 합류해 결의를 새롭게 다지며 준비는 O.K.! 과연 세레나는 사나, 로사 등 라이벌들을 제치고 데뷔전을 승리로 장식할 수 있을까? 드디어 트라이포카론, 비익대회의 막이 열린다…!
오늘은 1년에 한 번 있는 비익시티의 축제날. 이 날 가장 큰 맹세의 나무 아래에서 포켓몬에게 선물을 주면 서로의 유대관계가 깊어진다고 들은 지우와 세레나는, 둘이서 포켓몬들에게 줄 선물을 사러 나간다. 처음으로 피카츄도, 다른 포켓몬도 없이 단 둘이 쇼핑을 하게 되는 지우와 세레나… 어? 이건 설마 데이트!?