여행 도중, 전설의 포켓몬, 썬더를 기리는 축제가 열리는 우레마을을 방문하기로 한 지우와 친구들. 그러나 갑자기 큰 천둥이 울린다! 허둥지둥 근처 동굴로 몸을 피한 지우와 친구들은 그곳에서 부상 당한 구급대원과 만난다. 부상을 입은 구급대원을 대신하여, 마을 병원의 아이들에게 약을 전달하기로 한 지우. 그러나 동굴을 빠져나오니 화가 난 썬더의 모습이!?
세레나는 마지막 하나의 프린세스 키를 얻기 위해, 지우와 친구들과 함께 루키클래스가 열리는 플레이시티에 도착한다. 그러나 이 대회에는, 플레이시티의 명문가 출신 유력 퍼포머, 아멜리아도 참가한다. 강력한 라이벌의 등장에 불안한 듯한 세레나. 그리고 대회장에는, 전 칼로스퀸의 유명 프로듀서, 아젤리아가 나타나는데…?
숲 속에서 지우와 친구들은 라프라스 방위대를 자처하는 유리카 정도 나이의 3인조를 만난다. 세 사람은 상처 입은 라프라스를 보살피고 있었다. 가끔 구슬프게 우는 라프라스를 바다로 돌아가게 해 주려 하지만, 로켓단에게 방해 받아 큰 위기에 빠지고 만다! 포켓몬을 가지고 있지 않은 유리카와 라프라스 방위대는 과연 라프라스를 지킬 수 있을까!?
시트론의 모교에서 지우와 친구들은 야생 럭시오를 만난다. 이 럭시오는 예전에 시트론과 함께 연구를 하며 우정을 쌓은 포켓몬이었다. 하지만 약간의 오해로 둘은 멀어져 버렸다. 겨우 다시 만난 둘 사이에는 채울 수 없는 골이 생겨 버렸는데… 과연 시트론의 마음은 럭시오에게 전해져서 우정을 되찾을 수 있을까!?
칼로스퀸 엘르의 퍼포먼스를 보고 자극을 받은 세레나. 다음 순서였던 루키클래스를 연기하던 중 제멋대로 무대에서 퍼포먼스를 시작한 판짱이 공연장을 엉망진창으로 만들어 버린다. 판짱의 장난에 모두들 화가 나 있는 가운데 세레나는 퍼포먼스에 대한 판짱의 생각을 알게 되고 함께 퍼포먼스를 하고 싶다고 생각한다.
여행 중 들른 포켓몬센터에서 지우와 친구들은 실수를 연발하는 푸크린을 만난다. 한 편 마을에서 난동을 부리던 보만다의 소행으로 상처를 입은 포켓몬들이 계속해서 실려오고 푸크린은 패닉에 빠진다! 그런 푸크린을 다정하게 지원해 주던 간호순이 보만다에게 습격 당해 큰 위기에 빠지고! 간호순을 지키기 위해 푸크린이 보만다에게 맞선다!
여행 도중 지우와 친구들은 냐오닉스를 파트너로 데리고 있는 용아와 일남이라는 형제를 만난다. 두 사람은 각각 여행을 하고 있었고 오랜만에 집에 돌아가는 도중이었다. 그런데 오랜만에 다시 만났음에도 불구하고 두 사람 사이에는 험악한 분위기가 감돈다. 집에 돌아간 두 사람은 아버지로부터 후계자를 정하기 위한 시련을 부여 받게 되고 그 후계자 쟁탈전에 지우와 친구들도 가세하게 된다!
가라르광산에서 검은 레쿠쟈의 흔적을 쫓던 리코와 로드, 프리드는 익스플로러즈와 마주하게 되고, 설상가상으로 가라르 파이어에게도 공격을 받게 되는데…
가라르광산으로 검은 레쿠쟈를 찾으러 가던 리코 일행은 갑자기 내리는 비를 피하려 오두막으로 들어간다. 그곳에서 기운이 없는 몸지브림을 발견하게 되고, 리코는 치료를 위해 비행선으로 데리고 돌아가게 되는데…
검은 레쿠쟈에 대한 정보를 얻기 위해 엔진스타디움에 간 리코와 로드는 체육관 트레이너 연습생 연두의 안내로 관장인 순무를 만나게 된다. 순무는 대답 대신 레쿠쟈를 잡으려면 배틀 실력을 향상시켜야 한다며 트레이닝을 시키기 시작하는데…
리코와 로드, 머독은 엔진시티에서 도트가 부탁한 솜사탕을 구하기 위해 배틀카페에 들른다. 그곳에서 그들은 머독의 옛 파티시에 동료인 미첼을 만나게 되는데…
메타몽 프로젝트를 기념하여 공식 한국어 버전「메타몽 송」공개! 후렴구가 계속 귓가에 맴도는 메타몽 송, 다함께 불러볼까요?
여행 도중, 황야에서 식물을 기르기 위해 움직이는 로봇을 발견한 지우와 친구들. 사실 이 땅은 먼 옛날 녹음이 가득한 땅이었지만, 언젠가부터 물부족으로 인해, 더 이상 식물이 자라지 않게 되었다고 한다. 로봇을 도와주기 위해 시트론의 발명품과 포켓몬들의 능력을 사용하여 황야에 녹지를 되찾기 위해 노력하지만 과연…?
지우와 친구들을 노리는 로켓단. 우연히 로켓단은 칼로스지방에서 비밀리에 활동하던 플레어단과 마주치게 된다. 로켓단이 플레어단의 정보를 수집하는 도중 말랑이와 똑같이 생긴 기이한 생명체와 만나게 된다. 곧바로 포획하여 보스인 비주기에게 보내기 위해 계획을 짜지만, 그때 플레어단이 습격한다. 그곳에 누군가가 나타나는데. 갑자기 등장한 의외의 인물은!?
여행 도중, 승태와 다시 만나 배틀하게 되는데. 승태와의 배틀이 한창인 가운데, 또다시 지우의 개굴닌자 모습이 변했다! 이 현상은 도대체 무엇일까? 무엇이 원인인지 궁금한 지우와 친구들. 이튿날 아침, 포켓몬센터에서 휴식을 취하는 지우와 친구들을 로켓단이 습격한다! 위기에 빠진 피카츄를 구한 것은 바로…!?
3번째 프린세스 키를 얻기 위해, 열심히 연습하는 세레나. 그때, 포켓몬 퍼포머를 대상으로 한 댄스파티의 초대장이 도착한다. 퍼포머, 포켓몬과 함께 남녀가 한 팀이 되어 참가하는 이 파티에, 세레나와 이브이, 시트론, 파르빗이 참가하기로 한다. 그때 지우와 한 팀을 이루려는 밀피유가 등장하는데!?
리코는 소극적이고 내성적인 소녀. 하지만 한발 내딛기 위해 부모님이 다녔던 관동지방의 석영학교에 입학한다. 그곳에서 첫 번째 포켓몬인 나오하를 만나지만 나오하는 좀처럼 리코를 따르지 않는데…
리코는 프리드와 함께 브레이브 담청호에 도착해서 라이징 볼트태클즈의 멤버들을 만난다. 포켓몬들이 그들과 친밀하게 지내는 모습을 보고 나쁜 사람들 같지 않다고 안심한 것도 잠시 리코의 펜던트를 노린 익스플로러즈가 쫓아오는데…
메타몽 프로젝트를 기념하여 공식 한국어 버전「메타몽 송」공개! 후렴구가 계속 귓가에 맴도는 메타몽 송, 다함께 불러볼까요?
플레어단의 습격을 겨우 물리친 지우와 친구들. 유리카는 배틀 도중에 행방불명이 된 “아이”에 대한 걱정으로 안절부절인 듯한데… 다 함께 끝의 동굴 주변을 찾아보지만, 실수로 독개굴을 화나게 하여, 파르빗이 부상을 당했다! 게다가 파르빗의 부상을 자신의 잘못이라 생각한 유리카가 보여준 행동은!?