Dopo aver ricevuto il dono della conoscenza da un Perseide morente, Harper scopre che il Perseide era ricercato da un cacciatore di taglie, il quale ora ha spostato la sua attenzione su Harper.
Tyr fa un atterraggio di fortuna con l'Eureka Maru su un pianeta nietzscheano e perde la memoria.
Lo zio di Beka si candida per governare il Nuovo Commonwealth, ma l'equipaggio deve proteggerlo a seguito di un tentato omicidio.
L'equipaggio salva un gruppo di rifugiati ma scopre che sono stati sottoposti a degli esperimenti del governo e sono estremamente instabili.
Dylan viene incastrato per omicidio e deve ripulire la propria reputazione mentre è alla ricerca dei pezzi di un vaso che si dice possa donare al possessore le "benedizioni del cosmo".
I Geniti attaccano la moglie di Tyr e la colonia.
Dylan tenta di liberare una flotta di navi prigioniere, ma la flotta non sembra che voglia essere liberata. I loro AI temono di essere fatti schiavi dai nuovi capitani.
Un mostro spaziale mitologico cerca di divorare l'Andromeda.
L'equipaggio salva una dei vecchi fondatori del Commonwealth, ma scopre che ciò potrebbe creare più problemi di quanto possa valerne la pena.
Dylan perde conoscenza a causa di un buco nero e si ritrova in una realtà alternativa con una moglie e un figlio.
Un pianeta abitato da superstiti del Commonwealth guidato dall'ex compagna di Dylan viene invitato a entrare a far parte del Nuovo Commonwealth.
L'Andromeda ha il compito di scortare le navi mediche attraverso lo spazio Drago-Kazov.
L'equipaggio è alla ricerca di un ex capo del Commonwealth latitante.
L'Andromeda risponde a una chiamata di soccorso mentre una nave da carico viene attaccata.
L'equipaggio deve rubare un gioiello che è al centro di una faida tra un proprietario di Drift e il Than. Beka s'innamora di un capo della sicurezza con un passato da ladro.
Dylan, Beka, Rev e Tyr fanno un brusco atterraggio dopo essere scappati da una banda di Nietzscheani, ma dovranno presto affrontare una nuova minaccia: Rev ha fame.
Una vecchia memoria dell'Andromeda viene accidentalmente attivata, lanciando la nave in missione. Dylan e l'equipaggio non sanno come annullare il comando.
Beka conduce l'Andromeda a Tarn-Vedra, ma rimanere a lungo nello slipstream ha degli effetti collaterali. Beka inizia a usare Flash per combatterli e ne diventa presto dipendente.
Tyr fa un atterraggio di fortuna con l'Eureka Maru su un pianeta nietzscheano e perde la memoria.
Beka viene a sapere che l'ex socio in affari di suo padre è coinvolto nello spaccio di una droga che da forte dipendenza chiamata Flash.