I nostri eroi procedono separatamente alla ricerca di Naraku. Tanto Sango quanto Miroku vengono ingannati dalle illusioni di Byakuya il primo rischia di aprire il suo Vortice della mano destra e farsi inghiottire da esso, mentre la seconda è talmente ossessionata dall'idea di voler salvare Miroku, che appare disposta a sacrificare Rin pur di ottenere il suo scopo.
Mentre Sango e Miroku si addentrano sempre più in profondità nel corpo di Naraku, vengono colti da una strana illusione. La scena che si para loro davanti è quella della morte del padre di Miroku, risucchiato dal suo stesso Vortice della Mano Destra.
Kagome è tornata nella sua epoca per partecipare alla cerimonia di diploma e per festeggiare frettolosamente la propria ammissione al liceo. Dall'altra parte del pozzo, in epoca Sengoku, l'aspetta la battaglia finale contro Naraku, nonostante lei non abbia ancora recuperato i propri poteri spirituali.
Naraku è ormai prossimo a completare la Sfera dei Quattro Spiriti, e Kohaku è intenzionato a portare a termine il progetto di Kikyo, che prevedeva la purificazione di Naraku attraverso la luce contenuta nel suo frammento.
Kagome ha superato l'esame che doveva sostenere e Inuyasha l'ha raggiunta per riportarla nel passato. Nel frattempo, Kohaku continua a non riprendersi, a causa del frammento di sfera ormai diventato impuro.Tutto il gruppo è fermo nel villaggio di Kaede, che si sta prendendo cura del ragazzo.
Kagome si rende conto che lo sguardo di Magatsuhi l'ha privata del suo potere spirituale. Così, mentre Sesshomaru va in cerca di Magatsuhi e gli altri riposano, affidati alle cure di Kaede, Kagome torna nel suo mondo per prepararsi agli esami d'ammissione.
Sesshomaru convince Magatsuhi, lo spirito malvagio che alberga nella Sfera dei Quattro Spiriti, ad agire in prima persona per appropriarsi del frammento di Kohaku. Magatsuhi assume così una forma corporea e attacca il gruppo di Sesshomaru.
Hitomiko è una sacerdotessa Shinto dagli straordinari poteri spirituali, capace di creare una barriera impenetrabile dallo stesso Naraku. Quest'ultimo, grazie a uno stratagemma, riesce a ucciderla e a impossessarsi del suo corpo per attirare Kagome in una trappola.
Byakuya, per ordine di Naraku, consegna a Sesshomaru un frammento dello Specchio del Demone, in modo da donare a Tenseiga l'abilità di assorbire i poteri di altre armi demoniache con cui entri in contatto. Così equipaggiato, Sesshomaru decide di sfidare Inuyasha.
Reduce dalla battaglia contro Shishinki, Sesshomaru si reca da Totosai per chiedere lumi sul legame fra Tenseiga e Tessaiga, ma ottiene solo un'esortazione a dimenticare il suo rancore verso Inuyasha e la sua bramosia riguardo alle spade.
Sesshomaru si sta chiedendo perché non riesca a completare la nuova tecnica offensiva di Tenseiga, Meido Zangetsuha, quando compare un ragazzo che dice di conoscere il segreto della sua spada. Sesshomaru accetta di seguirlo e viene così condotto da Shishinki, un potente demone che in passato lottò contro suo padre.
Nella battaglia finale contro il demone d'ossa e sua figlia, Miroku adopera il vortice della mano destra ma viene sopraffatto dal dolore provocato dalla ferita di miasma che ha sul braccio, e Sango si trova costretta a spalmare del veleno sopra Hiraikotsu per poi colpire il demone d'ossa.
Il demone specchio di Kanna ha sottratto tutta l'energia demoniaca a Tessaiga e ora si appresta a eliminare Inuyasha e i suoi compagni con le stesse temibili tecniche di combattimento con cui essi si sono sempre difesi.
Inuyasha e gli altri vengono a conoscenza dell'uccisione di Gakusanjin da parte di un gruppo di ragazzini che usano delle giare per sparare fasci di folgore. Seguendoli arrivano in un tempio in cui vi è un'asceta di nome Goryomaru che possiede un braccio di demone.
Mentre Kohaku e Kagura distruggono i parassiti per conto di Naraku, forse per coprire il fatto che sono stati liberati da un demone montagna da lui disturbato, Inuyasha e gli altri si imbattono proprio in questa montagna semovente, Gakusanjin, che è tornato in vita dopo duecento anni di sonno.
Tornando sulle tracce di Naraku, i nostri si imbattono in demoni parassiti che prendono il controllo di demoni più grandi, come lo spirito volpe del villaggio che aiutano a liberare. Un parassita prende il controllo di Shippo, che così ha modo di vendicarsi delle angherie di Inuyasha.
Nelle vicinanze del punto in cui sorgeva il villaggio di Sango, Kirara va in giro per il bosco e ricorda il tempo in cui Sango e Kohaku vivevano felici assieme. Kohaku, che è sempre al servizio di Naraku anche se ora ricorda tutto del suo passato, si lascia andare anche lui ai ricordi aggirandosi nella stessa zona in cerca di Kikyo.
I bambini di un villaggio vengono rapiti da Ongokuki, un demone flautista che attira i bambini umani per venderli ad altri demoni. Fra le sue vittime c'è anche la piccola Rin, la compagna di viaggio di Sesshomaru.
Inuyasha entra nel pozzo per cercare Kagome, che invece spera di riprendere la sua vita normale. Il mezzo demone la raggiunge proprio mentre si appresta a cenare con i suoi cari. Spiegata la situazione, la ragazza torna nel passato insieme ad Inuyasha per combattere Yura. Unendo le forze i due riusciranno a sconfiggere il terribile demone dei capelli.
Kagome e Inuyasha vengono attaccati dalla crudele Yura, il demone dei capelli, una creatura malvagia e spietata che usa i capelli delle sue vittime come arma. Kagome, intanto, è riuscita a tornare a casa attraverso il pozzo, ma Inuyasha non riesce a vedere i capelli di Yura senza l'aiuto del sesto senso della ragazza e decide di andarla a cercare.