Jeannie si mette nei guai con un vigile guidando l'auto di Tony contromano. L'auto viene sequestrata e rilasciata solo quando Tony racconta al dottor Bellows che è piena di attrezzature segrete.
Il generale Peterson ed il dottor Bellows sospettano che Tony sia una spia quando viene avvistato a Parigi mentre fa colazione con Jeannie ed allo stesso tempo tiene un'importante riunione alla NASA.
Tony ottiene un lavoro nel settore privato dato che l'unico altro candidato aveva rifiutato. Arrabbiati che Tony abbandoni il suo sogno d'astronauta, Roger e Jeannie gli rendono il futuro cupo in modo che rifiuti li posto.
La signora Bellows vuole la bottiglia di Jeannie per il suo soggiorno ma Tony si rifiuta di separarsene. Allora lei se ne fa fare una copia ma in fabbrica si confondono e le danno l'originale.
Jeannie si mette nei guai con un vigile guidando l'auto di Tony contromano. L'auto viene sequestrata e rilasciata solo quando Tony racconta al dottor Bellows che è piena di attrezzature segrete.
Il generale Peterson ed il dottor Bellows sospettano che Tony sia una spia quando viene avvistato a Parigi mentre fa colazione con Jeannie ed allo stesso tempo tiene un'importante riunione alla NASA.
Jeannie concede a Roger un desiderio. Egli tuttavia lo spreca desiderando di non aver versato il caffè sulla giacca di Tony che Jeannie rende praticamente indistruttibile. Quando gliene viene concesso un altro, Roger chiede di diventare veramente diverte e viene trasformato in Groucho Marx.
La NASA sta addestrando uno scimpanzè per il primo volo sulla luna. Allora per scherzo Jeannie lo trasforma in un umano. Felice di non trovarsi più in gabbia, lo scimpanzè scappa e, tentando di ritrasformarlo in animale, Jeannie per sbagliio trasforma Tony in uno scimpanzè.
Roger organizza una festa per i suoi vecchi compagni di scuola. Il Capitano Yardley (la guest star Dabney Coleman) però gli ricorda che quella sera hanno un'importante riunione alla NASA. Tony e Roger allora si inventano una scusa per poter andare alla festa.
I Bellows si autoinvitano a cena e Tony cerca di liberarsi di Jeannie in modo da avere una cena leggermente più 'normale'. Furiosa, lei prepara una torta che avrà strani effetti su tutti gli ospiti.
Leggendo un libro, Tony scopre che se i geni sposano i mortali perdono i poteri. Allora, si propone immediatamente a Jeannie. Lei, ovviamente, accetta. Haji però non è d'accordo e gli mostra come sarà il loro futuro.
Tony desidera di poter parlare con Napoleone solo per un'ora, allora Jeannie lo rimanda indietro nel tempo. Napoleone però pensa che Tony sia una spia e progetta di ucciderlo. Tony deve tentare di convincerlo di non essere una spia.
Jeannie, vuole disperatamente sposare Tony e si affida ad un antico, potente e pericoloso incantesimo. Haji, il padrone di tutti i geni, le scombina i piani in quanto Jeannie ha disobbetito all'ordine di non fare incantesimi d'amore sui padroni.
Jeannie diventa la segretaria del generale Peterson sperando di convincerlo a far promuovere Tony. Tuttavia, sorgono complicazioni quando Jeannie è spospettata di essere una spia per non aver passato un controllo di sicurezza.
Jeannie rimanda Tony indietro nel tempo sulla nave da pirati del Capitano Kidd. Tony diventa capitano e gli viene ordinato di uccidere la prigioniera, Lady Diane Nelson. Tony capisce che quella è la sua bis-bis-bisnonna.
George sposta il bersaglio della sua rabbia su Louise a conclusione di questa storia in due parti.
Due donne litigano per George ad un funerale: sua madre e sua moglie!
A George serve un nuovo direttore per il suo negozio ma la persona più qualificata è una donna bianca che lui non vuole assumere. Inizia quindi una lite famigliare con Louise e Mamma Jefferson.
Lionel ha paura di dire al padre che ha fatto un incidente e ha ammaccato il paraurti del nuovo furgone per le consegne e la sua bugia si trasforma in un incubo per George.
Jenny è stanca dei bisticci tra i suoi due nonni, che sono l'uno contro l'altro sin da quando Tom e Helen si sono sposati. Questo porta Jenny, Louise e Mamma Jefferson a tramare un piano per far riappacificare i due.