El público queda impresionado ante la increíble actuación de Kōsei y Nagi. Takeshi le pide a Kōsei la oportunidad de competir contra él en una próxima competición de piano. Kōsei le pide a Kaori que toque con él una vez más.
Kōsei va al hospital a visitar a Kaori. Nagi sigue aprendiendo de Hiroko y Kōsei. Ante la proximidad del festival de la escuela, Kōsei y Nagi empiezan a preparar una actuación conjunta. Nagi está nerviosa pero Hiroko la tranquiliza.
Nagi se convierte en la primera estudiante de piano de Kōsei, aunque Hiroko la vigila atentamente ya que conoce sus intenciones ocultas. Kaori ya no puede seguir ocultándole su cada vez más deteriorado estado de salud a Kōsei.
El rodaje sigue adelante hasta que el comportamiento abusivo de Haruhi hacia Mikuru acaba con la paciencia de Kyon. Haruhi se marcha enfadada y Koizumi advierte de que si no hacen algo podría pasar algo peor que el espacio sellado.
Como directora, Haruhi hace lo que quiere hasta el punto de saltarse prohibiciones y rozar el delito para sacar adelante su película. Pero lo peor viene cuando le dice a Mikuru que dispare un rayo por los ojos… ¡y esta lo hace!
Haruhi ha decidido que la Brigada SOS proyecte una película independiente en el festival cultural. Asahina hará de viajera del tiempo, Nagato de extraterrestre y Koizumi de esper… Casi mejor pensar que se trata de una coincidencia.
Las aparentemente interminables vacaciones de verano han terminado y ha llegado el segundo semestre. Se acerca el momento del festival cultural y, como no podía ser de otra forma, Haruhi convoca una reunión de la Brigada SOS.
¿Otra vez se va a repetir lo mismo? En la última reunión de la Brigada SOS en la cafetería antes de que se reinicie el bucle, Haruhi se levanta de la mesa como de costumbre, pero Kyon no puede dejarla marcharse una vez más y le grita algo.
Antes de que suene el teléfono, Kyon ya sabe que será Haruhi y lo que le va a decirle y así la vida cotidiana sigue con una sensación de déjà vu. Las mismas vacaciones se repiten eternamente, pero Kyon es incapaz de hacer nada.
Según Koizumi, Kyon y sus amigos ya han vivido las mismas dos semanas más de 15,000 veces. Al contrario que los otros, Nagato recuerda todas y cada una de ellas, lo que lleva a Kyon a desear hacer algo que les saque del bucle eterno.
“Algo no está bien”. ¿Cuántas veces ha repetido Kyon esta frase en su cabeza? Kyon está viendo aburrido un partido de béisbol de secundaria cuando suena el teléfono y antes de cogerlo, él ya sabe de alguna manera que va a ser Haruhi.
Kyon y sus compañeros de la Brigada SOS están hartos de la repetición de acontecimientos orquestada por Haruhi. Sin embargo, no tienen ni la más mínima idea de cómo salir de ese bucle y los mismos días se repiten otra vez más.
Son las vacaciones de verano y eso significa un montón de actividades divertidas como partidos de béisbol, piscina y caza de cigarras. Pero por muy divertida que sea una actividad, dejar de serlo cuando se repite una y otra vez, una y otra vez.
El tiempo parece haber entrado en bucle desde el 17 hasta el 31 de Agosto. Koizumi parece satisfecho con la situación, Mikuru llora por no poder volver al futuro, Nagato guarda silencio y Kyon, no muy convencido, se pregunta por qué.
El ejército japonés y el norteamericano unen sus fuerzas para derribar los misiles nucleares, pero uno de ellos impacta cerca de la costa de Japón. El pulso electromagnético resultante desactiva todos los aparatos electrónicos permitiendo la entrada de una horda de zombies en la mansión de los Takagi.
Para su sorpresa, Takashi es elegido líder del grupo por sus compañeros. El padre de Saya, quien entrenó a las órdenes del padre de Saeko, le regala una nueva espada a la joven como muestra de gratitud. Justo cuando el grupo decide ir en busca del resto de sus familias, Shido aparece en la mansión.
Shū Tsukiyama se aproxima a Kaneki con misteriosas intenciones y este entabla amistad con él sin sospechar que pretende tenderle una trampa.
Yoshimura y Tōka Kirishima, los ghouls de la Cafetería Anteiku, enseñan a Kaneki a integrarse en la sociedad humana ocultando su verdadera naturaleza.
Mientras trata de adaptarse a su nueva naturaleza, Kaneki debe luchar para salvar a su amigo Hideyoshi de otro ghoul llamado Nishiki Nishio.
Tras sobrevivir al ataque de una enigmática criatura que trata de devorarle, Ken Kaneki es sometido a una operación que cambiará su vida para siempre.