Presionado por Taiga, una joven de apariencia adorable, pero salvaje, Ryuji, un joven de aspecto intimidante, pero bueno chico, accede a ayudarla a conquistar al chico del que está enamorada a cambio de que ella haga lo mismo por él.
Año 2032. La sociedad se encuentra completamente computerizada y la línea que separa a los humanos de las máquinas se ha difuminado hasta hacerse prácticamente indistinguible. Tras la desaparición de la Mayor Motoko Kusanagi, Batou, detective cyborg de la Sección 9 de Seguridad Pública, investiga una serie de homicidios cometidos por prototipos de androides diseñados para el sexo. Lo que comienza como la búsqueda de un asesino acaba convirtiéndose en la lucha desesperada de un hombre por aferrarse a lo que le queda de humanidad.
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Para proteger a la niña, la chica normal se convierte en Akudama y el mensajero, conmovido por ese acto, acepta la misión de reunir otra vez a los hermanos. Desde la guarida del mensajero, deciden que tienen que infiltrase en el cuartel general de los ejecutores para rescatar al niño, algo que logran gracias a la estrategia ideada por la chica normal.
Los ejecutores atrapan a los Akudama gracias a la traición de la doctora y el hermano mayor, para salvar a su hermana, decide entregarse para que así, junto a la persona normal, puedan refugiarse en la luna destruida. Mientras tanto, los demás Akudama no paran ni un segundo: la doctora ansía los hermanos inmortales, que no envejecen el maleante se une a la doctora para salvarse a sí mismo, y el asesino acompaña a la chica normal allá adonde va.
La Brigada SOS es invitada a un retiro de vacaciones de verano en una mansión en una isla remota y Haruhi está convencida de que ocurrirá algo extraño. Para desgracia de Kyon, al tercer día, el propietario de la mansión es hallado muerto.
Para alegría de Haruhi, una extraña acude a la Brigada SOS en busca de ayuda. El presidente del club de informática ha desaparecido y la investigación lleva a Kyon y a los otros hasta un espacio sellado donde son atacados por un grillo.
Sora y Shiro caen derrotados frente al abrumador poder de Izuna, pero los hermanos aún se guardan un as en la manga en la forma de Steph.
Tras recuperar la compostura, Shiro y Sora, con la ayuda de Jibril, se enfrentan a Izuna en un juego de polis y ladrones en el que parece imposible ganar.
Cuando comienza el juego contra los Hombres Bestia, los hermanos se quedan paralizados al descubrir que el campo de batalla se asemeja mucho a Tokyo.
Al comprender que es la única que recuerda a su hermano, Shiro descubre que Sora ha sido prácticamente borrado de la existencia tras jugarse su identidad.
Xialian es ridiculizada por sus compañeros de equipo cuando trata de romper la convención de que una mujer no puede ser corredora. Incapaz de soportarlo, desafía al piloto David a una carrera y da comienzo una batalla por el orgullo.
El representante de BNW y rico heredero europeo Al Lyon compra el almacén en el que duermen Appare y Kosame. Ante el riesgo de quedarse sin hogar, Appare realiza una apuesta arriesgada con el vehículo de gasolina de Al en juego.
Después del naufragio, un barco recoge a Kosame y Appare y los lleva hasta Los Ángeles. Allí, Appare descubre un asombroso vehículo de gasolina y al seguirlo hasta un circuito se entera la existencia de una carrera transcontinental.
Al samurái Kosame Isshiki se le confía la custodia del asocial inventor Appare Sorano, encarcelado por un invento que ha salido mal. Cuando Appare escapa de la cárcel, Kosame le sigue hasta una cueva ubicada debajo de su taller.
Los hermanos se enfrentan al desafío de los Hombre Bestia, una raza que lleva invicta décadas y borra los recuerdos de todos aquellos que derrotan.
Con el objetivo de recuperar la valiosa biblioteca de Elchea, Shiro y Sora desafían a Jibril a un juego de encadenar palabras que se materializan.
Los nuevos reyes de Elchea delegan las responsabilidades administrativas en Stephanie para dedicarse a recopilar información sobre sus enemigos.
Mientras Appare, Kosame y sus amigos se enfrentan a Gil y sus hombres, el tren cargado con Sofia y una gran cantidad de dinamita se aproxima por momentos al corazón de Chicago. ¿Conseguirán detener el complot y llegar hasta la meta?
Al enterarse de que Gil se oculta en un pueblo fantasma a 40 km de distancia, Appare y los otros se dirigen allí para rescatar a Sofia y continuar la carrera antes de que intervenga la Guardia Nacional y lo convierta en un campo de batalla.