Cuando una estrella cae de los cielos, un joven blader llamado Yuki la estaba esperando. Enseguida se pone en marcha para ir en busca de Gingka, pero no es tarea fácil, pues alguien ha atraído a Gingka a una isla para combatir contra su viejo rival Kyoya.
Tyson tiene que luchar con Zeo, pero en esa última batalla se descubre que Zeo no es humano, sino un robot creado por el doctor Zagart para reemplazar a su hijo, que murió en un trágido accidente. Según el doctor Zagart, si Zeo consigue capturar los cuatro Bit Beasts sagrados, el poder de éstos lo convertirá en un chico de verdad. Al final gana Tyson, quien convence a Zeo de que debe ser feliz con lo que es. Y Tyson es, una vez más, el campeón del mundo de BeyBlade.
En la final del Campeonato, Tyson se enfrenta a Gordo y vence. Zeo derrota a Max y el título tendrá que decidirse en un último combate entre Tyson y Zeo.
Zeo ha conquistado a Dranzer y Tyson empieza a temerlo. Visita solo el Bey Stadium donde tendrá que enfrentarse a él en la final y Kai lo desafía a un combate para que deje de dudar de sí mismo y se concentre en la batalla con Zeo. Tyson comprende que con sus amigos a su lado no puede perder.
Los Saint Shields retan a los BladeBreakers a un torneo en un parque de atracciones abandonado. Mariam y Max son los primeros en enfrentarse y vence Max. Mariam ve el gran vínculo que tiene Max con Draciel y empiza a dudar de su misión.
Denis, otros de los Blades de la doctora K, tiende una emboscada a Max en las entrañas de un edificio misterioso. Mariam lo ha seguido allí para luchar con él, pero cuando lo ve combatiendo con Denis, decide ayudarle.
Kai está entrenando solo en el parque y aparece un golpe de viento que empieza a destruirlo todo. Es uno de los Blades de la doctora K, que tiene un Bit Beast que controla el viento. Kai lucha con él y consigue derrotarlo.
Tyson está entrenando cuando llega Zeo de improviso y ve a Draciel y Dragoon en el aire y decide que él también quiere tener un Bit Beast. Los demás le dicen que no es un juguete, sino que tiene que ganárselo. La doctora K extrae un Bit Beast de la piedra y se lo da a Net, quien desafía a Tyson a un combate. Dragoon gana la batalla y Net huye llorando.
El señor Dickenson descifra la escritura misteriosa de la piedra y los niños descubren que los Saint Shields pertenecen a un clan que todavía usa ese lenguaje antiguo. Ozuma les cuenta su historia y la misión que les encomendó el clan: hacerse con los cuatro Bit Beasts sagrados y sellarlos en el interior de la piedra. Dunga los reta a combate y Ray acepta, pero el nuevo Vortex Ape de Dunga es demasiado para él y pierde a Driger, que queda encerrado en el interior de la piedra.
Tyson empieza a cansarse de que todo el mundo quiera sus Bit Beasts y convence a Kenny de que cree una plataforma para que el equipo se entrene en ella. Paga su mal humor con Zeo, un chico admirador suyo, pero luego se arrepiente y acepta entrenar con él para ayudarle a pasar los exámenes de BeyBlade.
Sabiendo que el doctor Zagart es la clave para encontrar la piedra perdida, los BladeBreakers deciden sair en su busca, aunque no saben por dónde empezar. El doctor Zagart y la doctora K diseñan un Blade nuevo con un Bit Beast de la piedra. Foxy desafía con él a Ray y está a punto de destruir su Blade, pero termina imponiéndose Ray. Los Saint Shields han visto la batalla y Ozuma jura que conseguirán los Bit Beasts de los BladeBreakes.
Cuando los chicos vuelven a Japón acompañados por Judy, van a un laboratorio abandonado, donde el señor Dickenson tuvo en otro tiempo una piedra similar con un socio suyo, el doctor Zagart, que desapareció con la piedra. Después de una batalla con Kenny y su nuevo BeyBlade, Tyson comprende que todavía tiene que aprender a controlar a su nuevo BeyBlade, Dragoon V2.
Max llegan al torneo y Alan le dice que, si lo derrota, le contará por qué aceptó ayudar a los malos a robar la piedra. La batalla es muy encarnizada, pero Max acaba ganado y Alan explica que participó en el robo para conseguir un Bit Beast poderoso, pero el nuevo Blade resultó ser un engaño.
Los chicos llegan a Nueva York de visita y Judy, la madre de Max, los lleva al laboratorio de la BBA, donde les muestra una piedra antigua con letras misteriosas y les dice que la piedra contiene Bit Beast. Alan, un amigo de Max, les hace una demostración con uno de ellos e invita a Max a un torneo de BeyBlade al día siguiente. Pero durante la noche, unos ladrones roban la piedra y los persigue la policía y Tyson. Este último descubre que uno de los ladrones es Alan.
Empezamos en mitad de una batalla entre Kane y Tyson. Este último va perdiendo hasta que Kai le dice que el único modo de vencer es que destruya el Cyber Bit Beast. Tyson recurre a toda su energía y lo destruye, pero eso hace que el edificio donde están se empiece a derrumbar y nuestros héroes tienen que salir corriendo después de recuperar a Draciel, que sigue preso en el laboratorio.
Tyson sigue luchando con Kane y los poderes del Bit Beast de éste se desarrollan a un ritmo alarmante. Dragoon está sufriendo tanto que Tyson le dice de mala gana que deje de luchar, pero el fiel Bit Beast hace acopio de fuerzas y sigue combatiendo. Tyson sigue su ejemplo y jura derrotar a Kane a toda costa.
El combate final enfrenta a Tyson contra Kane y su Cyber Dragoon. La batalla es feroz y en ella Tyson dice a Kai que el único modo de ganar es mejorando de técnica, no con la ayuda de Bit Beasts prefabricados.
Después de la victoria de Ray sobre Salima, los BladeBreakers llegan al cuarto nivel, donde Kai se enfrenta a Goki. El doctor B le hace un truco mental y Kai cree que está luchando con Wyatt. Tyson le cuenta lo que está pasando en realidad y Kai se sobrepone y derrota a Goki..
Ray se enfrenta a Salima en el segundo combate del torneo. Ray se entrega a fondo, no sólo por su equipo, sino por recuperar a la Salima que conoció una vez, antes de que estuviera controlada por el Cyber Bit Beast.
Los BladeBreakers se dirigen a un torneo contra el equipo Psykick, pero el conductor del autobús llena el vehículo de gas para dormir y mientras están inconscientes los traslada a una isla desierta donde habita el doctor B., que tiene la misión de capturar los Bit Beast de nuestros amigos con un Sistema de Captura de Bit Beasts.