Tyson sigue luchando con Kane y los poderes del Bit Beast de éste se desarrollan a un ritmo alarmante. Dragoon está sufriendo tanto que Tyson le dice de mala gana que deje de luchar, pero el fiel Bit Beast hace acopio de fuerzas y sigue combatiendo. Tyson sigue su ejemplo y jura derrotar a Kane a toda costa.
Tyson se recupera de una herida en el tobillo en el hospital. Gideon, entretanto, prepara otro plan siniestro y pide al doctor B que cree un Bit Beast virtual con todos los datos reunidos de los BladeBreakers. En otro lado de la ciudad, los Saint Shields planean también su estrategia para hacerse con los Bit Beasts de los BladeBreakers.
Nuestros héroes siguen atrapados en la isla, pero el doctor B les dice que si vencen a todos los miembros del equipo Psykick podrán salir. Faltan Tyson y Kai por luchar. Kai se enfrenta a Figel y gana. Después de eso, llega al faro con Kenny y Hilary y piden ayuda. Entretanto, Tyson lucha con Daryl y también vence. El laboratorio del doctor B explota debido a una sobrecarga de ordenador y el señor Dickenson y el abuelo aparecen en helicóptero y rescatan a los chicos en el último momento.
Los BladeBreakers están atrapados en una isla misteriosa y deciden separarse. Unos van hacia el faro para intentar comunicarse con el mundo exterior y pedir ayuda y otros, Tyson, Ray y Max, llegan accidentalmente al escenario de su próximo combate, donde tienen que enfrentarse a Bat, un Blader que ve en la oscuridad. Es Ray el que lucha con él y acaba ganando.
Los BladeBreakers se dirigen a un torneo contra el equipo Psykick, pero el conductor del autobús llena el vehículo de gas para dormir y mientras están inconscientes los traslada a una isla desierta donde habita el doctor B., que tiene la misión de capturar los Bit Beast de nuestros amigos con un Sistema de Captura de Bit Beasts.
Max y Ray se unen también con sus amigos, con lo que los BladeBreakers vuelven a estar juntos. La madre de Max les ofrece el Núcleo Mg, que produce un campo magnético similar al del Magtram, pero no es fácil de controlar y tienen que entrenar mucho para lograrlo.
Tyson y Kenny intentan averiguar qué había dentro del Beyblade de Snakey. Envían un mensaje a la madre de Max para pedirle ayuda y van también a ver al señor Dickenson. En su oficina conocen a un equipo nuevo llamado los Psykicks y liderado por el siniestro doctor B.
En el centro de entrenamiento de Gideon, dos de sus secuaces descubren a un Blader de talento llamado Snakey y le ofrecen ponerle un Magtram a su Blade. El Magtram es un mecanismo que crea un campo magnético y da una ventaja injusta al que lo usa. Tyson acepta pelear con Snakey y consigue ganar, pero los secuaces de Gideon graban la pelea.
Tyson y Kenny están otra vez sanos y salvos en tierra firme y acaban deduciendo que hay gente que quiere robar los Bit Beasts de todos los miembros de los BladeBreakers. Etretanto, en la escuela de Kai hay un chico, Wyatt, que quiere que le enseñe técnicas de juego. Kai no le hace caso hasta que un tal Dunga reta a Wyatt y éste roba a Dranzer para la batalla.
Los hombres de negro secuestran a Kenny y Hilary y Tison se ve obligado a hacer lo que le piden los captores para intentar liberarlos. Termina en un barco viejo, donde tiene que enfrentarse a un robot para que los secuestradores suelten a sus amigos.
Tyson no supera su derrota con el misterioso Míster X. Max y Ray reciben también la visita de figuras de encapuchados y pierden también con ellos. Kenny descubre algo interesante sobre el BeyBlade de Míster X , pero antes de que pueda decírselo a Tyson, éste se encuentra en el parque con Míster X y lo reta a una revancha.
Kenny descubre que Ozuma, el Blader encapuchado que derrotó a Tyson, usó un Bit Beast invisible. Tyson exige una revancha y vuelve a perder, porque Dragoon se niega a aparecer cuando lo llama. Entretanto, unos hombres vestidos de negro han tomado datos de los encuentros entre Ozuma y Tyson.
Tyson vuelve a casa después de ganar el campeonato mundial de BeyBlade y se cree muy importante. Pero llega tarde a la escuela y lo castigan, lo que hace que llegue también tarde a un torneo local. Cuando al fin se presenta, tiene que pelear con un chico misteriorso, míster X, que llega hasta la final para enfrentarse a Tyson
Gingka se encuentra en una batalla, no con Ryuga, sino con una versión mutada de él, una criatura horrible. Gingka se niega a retroceder, y él y Pegasus luchan duro contra Dark Ryuga y su bey L-Drago. Sin embargo, el poder de L-Drago parece ser demasiado para Pegasus, hasta que Gingka se da cuenta de que ganar por la fuerza no es la respuesta.
La pandilla todavía se está recuperando de la feroz victoria de Ryuga sobre Kyoya que dejó a su amigo débil e inconsciente. Ryuga le dice a Gingka que es culpa de Gingka que todos sus amigos sufren cuando luchan contra Ryuga, ya que solo los estaba usando para reunir más poder para llegar a Gingka. Gingka se da cuenta de que debe luchar duro contra Ryuga, por el bien de sus amigos.
Kyoya debe enfrentar a Ryuga en las semifinales de vida o muerte en Battle Bladers, el ganador para enfrentar a Gingka en el combate final. Kyoya se burla de Ryuga alegando que no puede enfrentarse solo a sus oponentes: primero debe robar el poder y la fuerza de otros espadachines. Ryuga acepta un desafío de Kyoya para hacer una batalla bey-to bey, sin restricciones.Open
Después de haber perdido todos sus puntos en un partido anterior con Phoenix, Gingka está decidido a ganar cada partido hasta que llegue a Battle Bladers y finalmente pueda derrotar a Ryuga. En su primer combate, conoce a Teru, un blader que solía ser un bailarín talentoso hasta que estuvo involucrado en un accidente en el escenario.
Gingka un nuevo Digital Power Launcher que calcula su poder de lanzamiento mientras practica y también lleva sus puntos ganados en la batalla. Cuando Tetsuya se disfraza, los engaña para que le den el Bey Pointer de Gingka y trata de huir con él. Phoenix viene al rescate, pero luego desafía la voluntad de Gingka como espadachín, es decir, si realmente estuviera decidido a ganar, cuidaría mejor su puntero.
Solo quedan seis bladers en el último Beyblade Challenge Match. En un giro sorpresa, se les dice que la ronda final será un Battle Royal donde los seis competirán entre sí por los 10,000 Puntos Bey. En una temible final, las alianzas se forman y rompen y las tensiones aumentan, pero al final solo un Blader sigue girando para reclamar la victoria ... ¡Kyoya!
En un día emocionante de lucha, Blader DJ anuncia cuatro batallas en cuatro estadios diferentes a la vez. Mientras Kenta lucha por contener al dúo fraternal de Dan y Reiki, Benkei mira esa batalla, pierde el foco en su propia batalla y es derrotado por Tsubasa. Hyoma gana por poco contra Hikaru, mientras que Yu derriba a su oponente tan fácilmente que está molesto porque no tuvo una batalla más dura.