Talon kämpft darum, eine mörderische Kreatur zu beherrschen, die sie heraufbeschworen hat. Garret und Janzo arbeiten derweil daran, die Ursache für die Seuche zu finden. Talons und Gwynns ungleiche Freundschaft festigt sich, während Talon versucht, mehr über die Mörder ihrer Familie herauszufinden.
Die Crew der "Ark One" wird von mysteriösen Halluzinationen heimgesucht. In ihren Wahnvorstellungen gefangen, sucht die Besatzung in einem Wettlauf gegen die Zeit nach der Ursache.
Die Wasserkrise auf der "Ark One" erreicht ihren Höhepunkt. Die angespannte Situation wird durch eine weitere Notlage verschärft: Das Raumschiff befindet sich auf Kollisionskurs mit einem Asteroiden.
Senator Brody (Bruce Boxleitner) befindet sich an Bord eines Flugzeuges, in das der Blitz einschlägt. Verletzt wird niemand, aber plötzlich ist eine junge Frau an Bord. Sie behauptet, aus der Zukunft zu kommen mit dem Auftrag, den Senator zu retten. Auch sagt sie voraus, es werde beim Landeanflug zu einem tödlichen Unfall kommen, wenn Brody nicht zuvor durch den Notausgang aus dem Flugzeug springe.
Nach außen sind Tom (Tate Donovan) und Wendy (Gabrielle Miller) ein perfektes, glückliches Paar. Nacht für Nacht jedoch leidet Tom unter schrecklichen Albträumen, in denen stets eine Feuersbrunst und ein weinendes Baby vorkommen. Tom findet schließlich heraus, dass er gar kein Mensch ist, sondern ein Androide. Daraufhin beschließt er zu fliehen und ein selbstbestimmtes Leben aufzubauen.
Die Ärzte haben die junge Anne Reynolds (Laura Leighton) bereits aufgegeben, da erwacht die Schwerkranke plötzlich wieder zum Leben. Sie erholt sich rasch, dennoch hat sie sich verändert. Unter Annes Haut wandert ein Tumor und zugleich leidet sie an Wahnvorstellungen. Dr. Field (Michael Ontkean) findet heraus, dass Anne einst eine Zwillingsschwester hatte. Diese übernimmt nun die Herrschaft über Annes Körper.
Jack wurde im Käfig zwischen Ratten und geheimnisvollen Schatten eingesperrt. Hier besucht ihn Lex, der ihm verspricht, ihn in der Verhandlung freizubekommen. Jack warnt ihn, er droht, wenn das nicht klappt, den anderen zu erzählen, dass Lex Wasserrationen stiehlt.
Kopfgeldjäger haben es auf Crichton abgesehen. Doch der hält sich mit Scorpius auf Moya versteckt. Gemeinsam versuchen die beiden die Verbrecher unschädlich zu machen. Doch dabei gibt es ein entscheidendes Problem: Die Kopfgeldjäger haben die restliche Moya-Crew geschrumpft und tragen sie in Behältern mit sich herum. Allzu leicht könnten Crichtons Freunde zwischen die Fronten geraten.
Critchon und Chiana sind in einem Videospiel gefangen, das aus den Gedanken des toten John programmiert wurde. Dort müssen die beiden die absurdesten Abenteuer bestehen. Sie treffen dort auf einen melkenden devilianischen Priester und einen Ritter, der Flammen aus seinem Allerwertesten spuckt. Zudem macht ihnen Scorpius als Butler das Leben schwer.
Beim Durchqueren eines von Crichton vorherbestimmten Wurmloches geschieht ein tragisches Unglück. Eine Raumpflanze, die sich an die Moya geheftet hat, fängt an, die Hülle des Schiffes zu zersetzen. Als die Crew versucht, sie mit Feuer zu töten, wächst die Pflanze jedoch weiter. Während das Durcheinander auf dem Schiff immer mehr zunimmt, vertraut Aeryn ihrer Kameradin Chiana ein Geheimnis an: Sie ist schwanger.
Crichton und seine Crew kehren auf Moya zurück. Sie freuen sich, endlich Aeryn wiederzusehen. Doch die ist an einem Hitzedelirium erkrankt. Es stellt sich heraus, dass die Lukythianer für ihr Leiden verantwortlich sind, da Aeryn ihren Anführer getötet hat. Ein Antiserum wollen sie ihr nur geben, wenn sie ihnen die Namen ihrer Komplizen nennt. Unterdessen haben die Peacekeeper eine Waffe entwickelt, die Leviathane tötet.
Crichton und seine Crew landen auf einem Lava-Planeten. Dort entdecken sie eine Höhle, in der Diebesgut gelagert wird. Beim Versuch, einige der Kostbarkeiten zu stehlen, löst Rygel einen Alarm aus. Er wird von einer sonderbaren Masse umschlossen und der Eingang zur Höhle verriegelt sich. Bald bekommen es die Freunde mit den Eigentümern der Schätze zu tun: Kämpfer mit undurchdringlichen Energieschilden.
Crichton überlebt den Mordanschlag, den Noranti auf ihn verübt hat. D'Argo und Sikozu planen indessen, mit Hilfe von Elack die Peacekeeper-Zerstörer unschädlich zu machen. Sie stürzen Elack auf den Planeten und können tatsächlich zwei der drei Zerstörer außer Gefecht setzen. Nun muss die Crew schnellstens fliehen, denn der Planet wird nicht mehr lange bewohnbar bleiben.
Crichton und Sikozu landen auf dem Planeten Arnessk. Dort sucht ein Ausgrabungsteam nach drei Sonden, die einst verwendet wurden um durch magnetische Störungen Unfrieden auf Arnessk zu stiften. Die Teamleiterin Vella hofft, mit Hilfe der drei Werkzeuge die Reaktion umkehren zu können. Eine alte Dame namens Noranti warnt Crichton jedoch, dass Vella die Sonden als Waffen gebrauchen will.
In naher Zukunft rafft eine Seuche alle Menschen jenseits der Pubertät dahin. Die übrig gebliebenen Teenager richten Kultur und Zivilisation zu Grunde. Fünfzehn Jahre später macht sich Einzelgänger Jeremiah auf die Suche nach dem verheißenen Valhalla-Sektor. Unterwegs trifft er auf den Dieb Kurdy.
Von ihrem mysteriösen Retter erfährt Talon dunkle Geheimnisse über sich selbst und ihren Stamm. In der Zwischenzeit untersucht Gate Marshall Wythers den Mord an einem Beamten des Prime Order und verspricht den Schuldigen zu exekutieren.
Talon, die einzige Überlebende des Stammes der Blackbloods, sinnt auf Rache an den Männern, die ihr gesamtes Dorf ausgelöscht haben. Ihre Reise führt sie zu einem abgelegenen Außenposten am Rande der Zivilisation, wo sie einem der Mörder ihrer Familie begegnet.
Die Besatzung der "Ark One" ist weiter um Ordnung bemüht. Während die Wasserversorgung an Bord zunehmend kritischer wird, ergibt die Untersuchung der Katastrophe mehr Fragen als Antworten.
Das Raumschiff "Ark One" verliert bei einer verheerenden Katastrophe große Teile seiner Crew. Nun liegt es an den verbliebenen Besatzungsmitgliedern, die Reise durchs All erfolgreich fortzusetzen.
Die Ärzte haben die junge Anne Reynolds (Laura Leighton) bereits aufgegeben, da erwacht die Schwerkranke plötzlich wieder zum Leben. Sie erholt sich rasch, dennoch hat sie sich verändert. Unter Annes Haut wandert ein Tumor und zugleich leidet sie an Wahnvorstellungen. Dr. Field (Michael Ontkean) findet heraus, dass Anne einst eine Zwillingsschwester hatte. Diese übernimmt nun die Herrschaft über Annes Körper.