Ein neues Mitglied an Bord der "Ark One" sorgt unter der Besatzung für Spannungen. Ein ungünstiger Zeitpunkt für Konflikte, denn der Crew machen technische Probleme am Raumschiff zu schaffen.
Die ziellos im All umhertreibende "Ark Three" stellt die Crew vor ein Rätsel. Finden sich Besatzungsmitglieder oder zumindest Hinweise an Bord und woher kommt dieses Raumschiff überhaupt?
Andy und Vince sind begeistert vom amerikanischen Bürgerkrieg, speziell von der Schlacht bei Gettysburg. Bei einem Event, der den Vorabend der Schlacht von 1863 rekonstruiert, lassen sie sich von Fotograf Prentice ablichten. Dessen Spezialkamera transportiert sie in die Vergangenheit, direkt in die Armee von Colonel Angus Devine. Der Fotograf hofft, dass Andy und Vince den Schrecken des Krieges begreifen und den Ausgang der Schlacht ändern. -Diesmal mit Gaststar Meat Loaf.
Der Wanderprediger Ezra und seine Tochter Sarah arbeiten mit kleinen Tricks, um die Menschen von ihren Fähigkeiten zu überzeugen. Als eine Mutter Ezra bittet, ihrem Sohn das Predigen zu lehren, ahnt er nicht, dass sein neuer Schüler tatsächlich übernatürliche Kräfte besitzt. Er und seine Mutter sind Außerirdische, die den religiösen Wahn der künftigen Anhänger nutzen wollen, um ihre Ziele zu erreichen.
Scott Bowman (D.B.Sweeney) wird von seinem Bruder verzweifelt in ihre Heimatstadt gerufen. Doch er kommt zu spät: Peter (Eric Breker) wurde ermordet. Scott ist entsetzt über die Veränderungen, die er in der Stadt wahrnimmt. Riesige Antennen dominieren die Landschaft und die Menschen agieren wie ferngesteuert. Eine Entwicklung, an der sein ermordeter Bruder maßgeblich beteiligt war.
Der Arzt Tumii kommt an Bord der Moya, um die Crew auf eine gefährliche Weltraumkrankheit zu untersuchen. Während Crichton und seine Freunde in Quarantäne sitzen, teilen sie sich ein Mahl aus sonderbaren außerirdischen Weichtieren. Mit schrecklichen Folgen: Jeweils zwei der Crewmitglieder werden untrennbar miteinander verbunden. Bevor Tumii die Crew heilen kann, fällt er einem Attentat zum Opfer.
Die Moya-Crew landet auf einem abgelegenen Planeten, der in einer Gegend der Galaxie liegt, aus der noch niemand lebend zurückgekehrt ist. Aeryn hat schon nach kurzer Zeit erschreckende Wahnvorstellungen: Sie sieht, wie sie ein Kind schlägt und wenig später einen Mann erschießt. Als Crichton von einem Insekt gebissen wird, fängt er ebenfalls an zu halluzinieren.
Kopfgeldjäger haben es auf Crichton abgesehen. Doch der hält sich mit Scorpius auf Moya versteckt. Gemeinsam versuchen die beiden die Verbrecher unschädlich zu machen. Doch dabei gibt es ein entscheidendes Problem: Die Kopfgeldjäger haben die restliche Moya-Crew geschrumpft und tragen sie in Behältern mit sich herum. Allzu leicht könnten Crichtons Freunde zwischen die Fronten geraten.
Critchon und Chiana sind in einem Videospiel gefangen, das aus den Gedanken des toten John programmiert wurde. Dort müssen die beiden die absurdesten Abenteuer bestehen. Sie treffen dort auf einen melkenden devilianischen Priester und einen Ritter, der Flammen aus seinem Allerwertesten spuckt. Zudem macht ihnen Scorpius als Butler das Leben schwer.
Beim Durchqueren eines von Crichton vorherbestimmten Wurmloches geschieht ein tragisches Unglück. Eine Raumpflanze, die sich an die Moya geheftet hat, fängt an, die Hülle des Schiffes zu zersetzen. Als die Crew versucht, sie mit Feuer zu töten, wächst die Pflanze jedoch weiter. Während das Durcheinander auf dem Schiff immer mehr zunimmt, vertraut Aeryn ihrer Kameradin Chiana ein Geheimnis an: Sie ist schwanger.
Crichton und seine Crew kehren auf Moya zurück. Sie freuen sich, endlich Aeryn wiederzusehen. Doch die ist an einem Hitzedelirium erkrankt. Es stellt sich heraus, dass die Lukythianer für ihr Leiden verantwortlich sind, da Aeryn ihren Anführer getötet hat. Ein Antiserum wollen sie ihr nur geben, wenn sie ihnen die Namen ihrer Komplizen nennt. Unterdessen haben die Peacekeeper eine Waffe entwickelt, die Leviathane tötet.
Crichton und seine Crew landen auf einem Lava-Planeten. Dort entdecken sie eine Höhle, in der Diebesgut gelagert wird. Beim Versuch, einige der Kostbarkeiten zu stehlen, löst Rygel einen Alarm aus. Er wird von einer sonderbaren Masse umschlossen und der Eingang zur Höhle verriegelt sich. Bald bekommen es die Freunde mit den Eigentümern der Schätze zu tun: Kämpfer mit undurchdringlichen Energieschilden.
Bray und Salene werden ausgerechnet von Trudy beim Küssen erwischt. Sie ist außer sich und knallt Salene eine. Doch Bray erklärt der eifersüchtigen Trudy, dass er sich keine Zukunft mit ihr und dem Baby vorstellen kann. Er stürmt aus der Mall, um endlich alleine zu sein. Auch Zandras Essenseinladung für Lex läuft ganz anders als geplant. Und dann schreit auch noch das Baby die ganze Zeit, doch kümmert Trudy sich nicht um ihre Tochter …
Cloe wird von den Locos verfolgt und rennt in panischer Angst davon. Sie stürzt und verstaucht sich den Knöchel. Sie scheint verloren, doch in letzter Sekunde wird sie von einem geheimnisvollen Mädchen gerettet: Tai-San! Die beiden machen sich auf den Weg zurück zur Mall. Dal ist ziemlich sauer auf Jack, denn der beansprucht allen Ruhm für die Wasserfilteranlagen für sich. Doch trotz dieser genialen Erfindung muss sich eine Gruppe auf den gefährlichen Weg zum Bach machen, da das Regenwasser alleine nicht ausreicht, um den Durst des ganzen Stammes zu stillen.
Jeremiah und Kurdy ziehen weiter, um mehr über die Hintergründe der großen Seuche zu erfahren. Zufällig kommen sie an jenem Ort vorbei, in dem Kurdy aufgewachsen ist. Dieser erinnert sich plötzlich, dass seine Mutter am Virus erkrankt war und daher seinen Vater gebeten hatte, sie zu erschießen.
Talon verspricht, das mysteriöse „Buch der Namen“ zu finden.
Nachdem er ein mächtiges Geheimnis entdeckt hat, erpresst Wythers Gwynn und besteht darauf, dass sie ihm erlaubt, Talon zu töten. In der Zwischenzeit kommen fünf Killer aus Talons Vergangenheit in die Stadt, um unerledigte Angelegenheiten zu regeln.
Die Crew der "Ark One" entdeckt einen Planeten, der über den dringend benötigten Raumschifftreibstoff verfügt. Ein frisch gelüftetes Geheimnis belastet währenddessen Lane.
Ein Strahlungsleck führt auf der "Ark One" zu mehreren Todesfällen. Kann die Crew die Angelegenheit rechtzeitig unter Kontrolle bekommen? Unterdessen nehmen die Mordermittlungen von Felix eine seltsame Wendung.
Scott Bowman (D.B.Sweeney) wird von seinem Bruder verzweifelt in ihre Heimatstadt gerufen. Doch er kommt zu spät: Peter (Eric Breker) wurde ermordet. Scott ist entsetzt über die Veränderungen, die er in der Stadt wahrnimmt. Riesige Antennen dominieren die Landschaft und die Menschen agieren wie ferngesteuert. Eine Entwicklung, an der sein ermordeter Bruder maßgeblich beteiligt war.