Auf ihrer Reise kommen Ashura, Taizou und Kanna in das Dorf, das von der Fruchtbarkeit des Shinju profitiert. Doch was zunächst positiv erscheint, stellt sich als tödlich heraus und fordert eine ethische Entscheidung von Ashura.
Indora muss seinen Bruder festnehmen, als dieser eine Straftat begeht. Klar, dass das nicht förderlich für deren Beziehung ist – das erkennt auch ihr Vater. Daraufhin schickt er seine Söhne auf eine Reise, die letztendlich über seinen Erben entscheiden wird.
Ashura und Indora sind Brüder und die Kinder von Hagoromo Otsutsuki. Doch trotz der gemeinsamen Gene ist Ashura kämpferisch nicht annähernd so talentiert wie sein älterer Bruder Indora. Das führt zu einem Zwiespalt zwischen den Brüdern, der noch immer Auswirkungen zeigt
Hagoromo erzählt eine weitere Geschichte: Die, der Entstehung des Ninshu. Die wiederbelebten Hokage lauschen gespannt. Was hat das Ende der Erzählung für Auswirkungen auf Naruto und Sasuke?
Kaguya sieht in Naruto und Sasuke ihre Söhne Hagoromo und Hamura, die sie, wie sich aus ihren Bemerkungen schließen lässt, nicht besonders gut leiden kann. Um sich die Chance auf Flucht zu ermöglichen, setzt Naruto ein lange im Geheimen trainiertes Jutsu ein, das alle Anwesenden sehr überrascht.
Narutos und Sasukes Kampf ist beendet, dennoch sieht Sasuke keinen Grund mit Naruto ins Dorf zurückzukehren. Das führt zu einem erneuten Kampf, wobei sich ihr Schicksal, Feinde zu sein, offenbart – können sie dagegen ankommen und ihre Freundschaft neu aufleben lassen?
Orochimaru ist tot und Sasuke zur anderen Seite übergelaufen. Diese Informationen gibt Tsunade den Kriegern weiter, als langsam wieder Ruhe in das Dorf einkehrt. Die Teams werden aufgeteilt und auf Missionen geschickt, als Team 7 einen überraschenden Zuwachs bekommt.
Naruto hat sich in Pains zweiten Mond in das Kyuubi verwandelt, das Amok läuft. Dank Narutos Siegel kann es dennoch keinen großen Schaden anrichten, aber es muss unbedingt beruhigt werden. Wer kann nah genug an Narutos Inneres herantreten, um das Feuerungeheuer zu zähmen, und was hat Narutos Geburt mit dem Monster zu tun?
Shikamaru und die anderen Ausreißer finden Naruto bewusstlos auf der Turmspitze, der letzte Angriff war zu viel für ihn. Doch ihnen bleibt nicht lange Zeit, um sich die Wunden zu lecken: Sasuke ist wieder verschwunden. Zeitgleich müssen Minato und die anderen Dorfbewohner ihr Zuhause vor Angreifern beschützen, doch sind sie stark genug, um alle zu retten?
Neji ist zurückgeblieben und kämpft gegen die ANBU-Ne, um den anderen den Vorsprung zu sichern. Es sind nur noch zwei Angreifer übrig, doch die werden seine größte Herausforderung in diesem Kampf. Naruto arbeitet sich unterdessen weiter durch Orochimarus Turm, als er unerwartet von einem ANBU angegriffen wird.
Der Kampf gegen die ANBU-Ne ist in vollem Gange, als Naruto die Intention hinter dem Angriff versteht: Die Gegner wollen verhindern, Sasuke von der Begegnung mit Orochimaru abzuhalten. Können sie ihrem Freund nach dieser Erkenntnis noch zu Hilfe eilen, oder ist es schon zu spät?
Sasuke macht sich trotz des Verbots auf den Weg zu Orochimaru. Seine Freunde und sein Mentor versuchen ihn abzuhalten, doch vergebens. Naruto und die anderen haben kurz darauf ein Krisengespräch – sollen sie Sasuke auf seiner gefährlichen Reise folgen?
In Tsunades Traum ist Sasuke wegen seines großen Erfolgs nun zum Leutnant der Konoha-Polizei befördert worden.
Tsunade befindet sich im Traum nun an der Stelle, an der Sasuke das Chidori von Kakashi erwirbt. Indessen will sich Itachi mit dem Dorf versöhnen.
In Tsunades Traum wird es Tag. Der zweite Teil des Buchs beginnt und die meisten Konoha-Nin sind zurück.
Tsunade liest weiter: Es stellt sich heraus, dass der maskierte Mann kein geringer als Nejis Vater ist.
Tsunade ist in ihrem Traum an der Stelle des Buchs angekommen, an der das Kyuubi aus Narutos Siegel bricht. Jiraiya muss es schnell erneuern.
Tsunades Traum hält weiter an. Naruto wurde vom maskierten Mann paralysiert.
Im Traum ist Tsunade weiterhin in Jiraiyas Buch vertieft. Naruto und Neji stehen immer noch dem maskierten Mann gegenüber, der wissen will, ob Konoha-Nin gute Menschen sind.
Tsunade träumt immer noch und liest weiter Jiraiyas Buch. Naruto und Neji treffen auf den Mann, der für das Verschwinden der Konoha-Jonin verantwortlich ist.