Neji ist zurückgeblieben und kämpft gegen die ANBU-Ne, um den anderen den Vorsprung zu sichern. Es sind nur noch zwei Angreifer übrig, doch die werden seine größte Herausforderung in diesem Kampf. Naruto arbeitet sich unterdessen weiter durch Orochimarus Turm, als er unerwartet von einem ANBU angegriffen wird.
Der Kampf gegen die ANBU-Ne ist in vollem Gange, als Naruto die Intention hinter dem Angriff versteht: Die Gegner wollen verhindern, Sasuke von der Begegnung mit Orochimaru abzuhalten. Können sie ihrem Freund nach dieser Erkenntnis noch zu Hilfe eilen, oder ist es schon zu spät?
Sasuke macht sich trotz des Verbots auf den Weg zu Orochimaru. Seine Freunde und sein Mentor versuchen ihn abzuhalten, doch vergebens. Naruto und die anderen haben kurz darauf ein Krisengespräch – sollen sie Sasuke auf seiner gefährlichen Reise folgen?
In Tsunades Traum ist Sasuke wegen seines großen Erfolgs nun zum Leutnant der Konoha-Polizei befördert worden.
Tsunade befindet sich im Traum nun an der Stelle, an der Sasuke das Chidori von Kakashi erwirbt. Indessen will sich Itachi mit dem Dorf versöhnen.
In Tsunades Traum wird es Tag. Der zweite Teil des Buchs beginnt und die meisten Konoha-Nin sind zurück.
Tsunade liest weiter: Es stellt sich heraus, dass der maskierte Mann kein geringer als Nejis Vater ist.
Tsunade ist in ihrem Traum an der Stelle des Buchs angekommen, an der das Kyuubi aus Narutos Siegel bricht. Jiraiya muss es schnell erneuern.
Tsunades Traum hält weiter an. Naruto wurde vom maskierten Mann paralysiert.
Im Traum ist Tsunade weiterhin in Jiraiyas Buch vertieft. Naruto und Neji stehen immer noch dem maskierten Mann gegenüber, der wissen will, ob Konoha-Nin gute Menschen sind.
Tsunade träumt immer noch und liest weiter Jiraiyas Buch. Naruto und Neji treffen auf den Mann, der für das Verschwinden der Konoha-Jonin verantwortlich ist.
Hagoromo erzählt eine weitere Geschichte: Die, der Entstehung des Ninshu. Die wiederbelebten Hokage lauschen gespannt. Was hat das Ende der Erzählung für Auswirkungen auf Naruto und Sasuke?
Kaguya sieht in Naruto und Sasuke ihre Söhne Hagoromo und Hamura, die sie, wie sich aus ihren Bemerkungen schließen lässt, nicht besonders gut leiden kann. Um sich die Chance auf Flucht zu ermöglichen, setzt Naruto ein lange im Geheimen trainiertes Jutsu ein, das alle Anwesenden sehr überrascht.
Eine weitere Geschichte aus Konohas Vergangenheit: An der Grenze von Suna-Gakure und Konoha-Gakure kommt es zu Unruhen und beide Dörfer schicken ein Team los, um dort nach dem Rechten zu sehen. Die beiden Dörfer sind erst seit kurzem verbündet und so ist es wichtig für die diplomatischen Beziehungen, dass die Unruhen schnell geschlichtet werden. Gaara aus Suna zieht mit Yaoki und Korobi los, während Konoha Kakashis Team aussendet. Gemeinsam machen sie sich auf den Weg, doch da Suna-Gakure dem eigenen Kameraden Gaara nicht traut, schickt man ihm heimlich Leute hinterher, die ihn bei der erstbesten Gelegenheit festnehmen sollen. Es kommt zum Kampf und Gaara erfährt das erste Mal, was Freundschaft ist, denn Naruto und sein Team stehen absolut hinter Gaara und unterstützen ihn. Es gelingt ihnen, die Abgesandten außer Gefecht zu setzen und dann machen sie sich auf den Weg, um ihre eigentliche Mission zu erfüllen.
Sakura erinnert sich an eine frühere Mission zurück, bei der Naruto mal wieder für ordentlich Schwiergkeiten gesorgt hatte. Damals lernten sie Tsukado kennen, als das Team 7 in einem Dorf ein Nachtquartier suchte. Tsukado war auf „Rachefeldzug“, doch leider ein viel zu netter Mensch, um sich wirklich rächen zu wollen. Er glaubte nur, dass er das für seinen Clan tun müsse. Er forderte einen Typen namens Katazu heraus. Leider hielt sich im Dorf auch eine Bande windiger Gestalten auf und deren Anführer Kanabun versuchte, aus dem Kampf Profit zu schlagen und nahm Wetten auf die Kontrahenten an. Naruto und sein Team schaltete sich ein und gemeinsam gelang es ihnen, Kanabun in die Flucht zu schlagen.
Naruto, Guy, Kakashi und Killerbee stehen weiter Madara gegenüber, und scheinen chancenlos gegen ihn zu sein, egal welche Techniken sie auch anwenden. Jeder scheinbare Treffer gleitet nur durch Madaras Körper hindurch. Das ist ein Problem, denn Madara droht, den Juubi wiedererstehen zu lassen, der die Kraft aller Bijuus in sich vereint.
Sasuke, Suigetsu und Jugo befinden sich in der Höhle mit dem versiegelten Kabuto. Suigetsu ist außer sich, als Sasuke berichtet, dass er Orochimaru wiedererstehen lassen und ihn um einen Gefallen bitten will. Sasuke setzt sich allerdings über ihn hinweg. Orochimaru gibt zu, dass er es auf Sasukes Körper abgesehen hat, aber dazu sei er noch zu schwach.
Sakura kümmert sich um Sasame, der es anscheinend schlecht geht. Jiraiya interessiert sich natürlich für das Mädchen, das vom Fuuma Clan stammt. Bei einem Picknick zeigt sich aber, dass Sasame nicht so hilflos ist, wie es den snschein machte. Plötzlich wird sie aber von den Fuuma-Clan-Mitgliedern Kamikiri Jigumo und Kagero festgehalten. Die drei haben den Clan verraten und arbeiten inzwischen für Orochimaru, der ihnen versprochen hat, ihren Clan beim Wiederaufbau zu unterstützen…
Jiraiya, Naruto und Sakura erreichen mal wieder ein Dorf, in dem so richtig das Leben tobt – was, wie Naruto und Sakura bereits ahnen, prompt dazu führt, dass Jiraiya sich auf den Weg zur ‚Informationsbeschaffung‘ macht. In einer Bar behauptet eine Frau, ihm weiterhelfen zu können, lockt ihn aber dann in einen Hinterhalt…
Danzo, der kurzzeitig verschwunden war, ist von den Anbu gefunden und zurück ins Dorf gebracht worden. Tsunade verhört ihn, weil sie Informationen von ihm haben möchte, doch er verhöhnt sie nur. Außerdem scheint er Koharu und Homura hinter sich zu haben, die Tsunades gemäßigte Politik offenbar auch nicht gutheißen…