Nachdem er etwas von Mitsuki gehört hat ist Boruto ununterbrochen unterwegs, um zu verhindern, dass weitere Vorfälle passieren und der Verbrecher nicht weiterhin sein Unwesen treibt! Währenddessen erscheint ein außerirdisches Biest namens „Nue“. Die näher rückende Gefahr für das Dorf ruft sogar den pensionierten sechsten Hokage Kakashi Hatake auf den Plan.
Shikamaru und Shiho sortieren Fotos, die in den Trümmern Konohas gefunden wurden und versuchen, sie ihren Besitzern zuzuordnen. Naruto entdeckt ein Foto mit einer Tulpe, das ihn an eine alte Geschichte erinnert: Bei einer Unternehmung fällt Naruto in eine Felsspalte und reißt dort versehentlich einen Zettel ab. Dies ist ein Siegel, das einen Geist gefangen hielt, der ihm von nun an auf Schritt und Tritt folgt. Kisuke weiß nicht, wer er ist und Naruto versucht herauszufinden, wie er gestorben ist und warum er nicht in Frieden ruhen kann.
Tenzo flieht mit Yukimi vor einem grausamen Ritual, um sie zu retten. Beide werden von Kakashi verfolgt, der Yukimi als Köder benutzen will, um Orochimaru zu finden und zu stellen. Orochimaru hat den Iburi-Clan überzeugt, dass sein Ritual einem größeren Wohl, nämlich einer besseren Zukunft für die kommende Generation gilt.
Kakashi trifft in den Tiefen eines Höhlensystems auf den Iburi-Clan, dessen Mitglieder sich im Kampf in Rauch verwandeln können. Sie nehmen Kakashi gefangen und es stellt sich heraus, dass sie Anhänger von Orochimaru sind und jeden umbringen wollen, der sich gegen ihn stellt. Verwundert stellt Kakashi fest, dass sich ein ANBU Ne unter die Höhlenbewohner gemischt hat. Es ist Kinoe.
Es stellt sich heraus, dass die Ninja, die Hinata entführt haben, zum Kamizuru-Clan gehören, der ein alter Rivale des Aburame Clans war. Mit dem Spur-Käfer wollen sie versuchen, ihren früheren Ruhm wieder herzustellen. Hinatas Begleiter wollen den Käfer verstecken, werden aber in eine Falle gelockt. Eingesperrt in einen Kokon fällt Hinata in einen Fluss…
Shino, Kiba, Hinata und Naruto sind auf der Suche nach dem Käfer mit dem besonderen Geruchssinn, der ihnen helfen soll, Sasuke schneller zu finden. Aber das ist gar nicht so einfach, denn es gibt so viele unterschiedliche Merkmale bei den Insekten, und trotzdem sind irgendwie alle gleich. Naruto ist sich seiner Sache immer wieder sicher, aber letztendlich hat er doch den falschen Käfer gefunden, was gar nicht ungefährlich ist. Zu allem Übel sind drei Mitglieder des Kamizuru Clans, deren Stamm angeblich von Narutos Aburame Clan aufgelöst wurde, auch auf der Suche nach dem Käfer. Sie beschränken sich allerdings darauf, abzuwarten, bis die anderen Erfolg haben, um ihnen dann den Käfer wegzunehmen…
Naruto erhält von Kakashi die niederschmetternde Information, dass dieser nicht sicher ist, ob Naruto den nächsten Schritt der Chakra-Manipulation überhaupt schaffen wird. Denn sogar der Hokage der vierten Generation ist daran gescheitert. Das spornt Naruto aber natürlich noch mehr an…
Tsunade hat verschiedene Teams losgeschickt, die die beiden feindlichen Akatsuki-Leute aufspüren sollen. Doch bisher gibt es keine Erfolgsmeldungen. Niemand hat sie gesehen. Sie scheinen wie vom Erdboden verschluckt zu sein. Als Asuma, Shikamaru und Co. zum Feuertempel kommen, begegnen ihnen dort nur noch wenige Mönche…
Iruka bemüht sich weiterhin, die richtigen Worte zu finden, als überraschenderweise Naruto bei ihm auftaucht. Warum ist er am Tag seiner Hochzeit nicht bei seiner zukünftigen Frau? Iruka macht sich Sorgen – zu Recht?
Die Hochzeit beschäftigt alle. Kakashi hat ein personelles Problem, er muss seine Mission besetzen, weiß aber nicht mit wem, denn alle sind bei der Hochzeit eingeladen. Auch Iruka macht das Fest zu schaffen.
Kiba und Shino stehen unter Druck: Die Geschenke der anderen sind grandios. Die beiden müssen kreativ werden. Wie gut, dass die letzte Mission mit Naruto als Junggesellen ansteht, da kann man doch einiges anstellen.
Fast alle haben ihre Geschenke zusammen, aber Kazekage hat noch nichts gefunden. Während der Führung durch das Dorf kommt er aber zu dem Schluss, dass Materielles nicht so wichtig ist wie etwas Persönliches.
Shikamaru zermartert sich weiterhin den Kopf über ein passendes Hochzeitsgeschenk für Hinata und Naruto, doch zum Glück naht Hilfe bei der Entscheidung.
Was soll man dem Brautpaar nur schenken? Die Suche nach dem perfekten Geschenk erhitzt die Köpfe der Freunde mehr als gut für sie ist.
Naruto und Hinata werden heiraten. Nach altem Brauch sollen ihre Freunde ein Video für das Brautpaar drehen, in dem sie ihre Glückwünsche für die beiden aussprechen. Doch die richtigen Worte zu finden ist schwieriger als anfangs gedacht.
Auch Sasuke muss sich seiner Vergangenheit stellen: Das ambivalente Verhältnis zwischen Sasuke und Itachi besteht schon seit ihrer Kindheit. Glücklicherweise hat er Sakura, die ihn stützen will, obwohl sie selbst mit Teenager-Problemen zu kämpfen hat.
Naruto und Hinata sind mittlerweile enge Freunde, doch in ihrer Kindheit waren sie getrennt und unterschiedlich wie Tag und Nacht: Naruto hatte nichts und hat selbst in seiner Not noch mit anderen geteilt, Hinata hatte es als Clan-Nachkomme um einiges komfortabler.
Sasuke ist endlich wieder zurück und entschuldigt sich bei seinen alten Freunden für alle Probleme, die er ihnen bereitet hat. Unterdessen muss Sakura die Verletzten der Schlacht pflegen, für die Gefallenen wird ein Fest vorbereitet, auf dem Naruto wichtige Informationen für sein weiteres Vorgehen erhält.
Durch den harten Kampf bewusstlos geworden, findet sich Sasuke in einem Traum wieder, in dem um Naruto und Itachi geht. Als er wieder zu sich kommt, liegt Naruto neben ihm und die beiden erzählen sich, wie sie sich eigentlich schon als Kinder in ihrer Einsamkeit verbunden fühlten und sich gegenseitig beneideten. Nach und nach kommt es zu einer Versöhnung.
Sie sind sich ebenbürtig, sie kennen sich und können den nächsten Schritt des Gegners vorab einschätzen. Das macht das Duell im Tal des Endes nicht nur spannend, sondern lebensgefährlich. Nur einer kann das Schlachtfeld lebend verlassen.