Da Masamune zu spät zur zweiten Runde kommt, springt Yu für ihn ein. Aleksey und Anton haben die Arena dementsprechend präpariert, indem sie mit Störsendern Yus Special Move "Libra Inferno Blast" verhindern. Als Masamune endlich das Stadion erreicht, verirrt er sich und findet im Keller Anton, der gerade mit den Störwellensendern operiert.
Da Masamune noch nicht wieder aufgetaucht ist, beschließt das Team Gangan Galaxy Gingka als Stürmer in den ersten Kampf zu schicken. Sein Gegner ist Nowaguma, der zwar nicht der Stärkste des Teams Lovushka ist, aber wesentlich stärker als der Nowaguma, als den er sich im Zug ausgegeben hat.
Für Gingka und seine Freunde scheint die Zugfahrt ins ferne Sibirien, wo der zweite Ausscheidungswettkampf der "Beyblade-Weltmeisterschaften" stattfinden soll, unendlich lang zu sein. Anton, der Teamleiter des russischen Teams Lovushka, hat Aleksey damit beauftragt, die Daten von Madokas Computer zu kopieren. Um sie abzulenken, verwickelt Aleksey die staunende Madoka in pseudo-wissenschaftliche Vorträge.
Ein unbekannter Blader, der aus einem sehr reichen wie auch aristokratischen Haus stammt, macht sich auf, um in der Runde A gegen das Team Desert Blaze zu kämpfen. Während Julian, der Repräsentant der EU, sich nur mit Symbolen des Geldes und des Glamours umgibt, trainieren die drei Jungs von Desert Blaze mit ihren Beys in der Wüste und gewinnen rasch die Sympathie von Gingka und seinen Freunden.
Doji gelingt es, Phoenix und seinen Bey in den Abgrund der Dunkelheit zu stürzen, aus dem es kein Entrinnen mehr geben soll. Da Phoenix aber ein ewiges Leben hat, wird er von Kenta geweckt und besinnt sich seiner Kraft. Er durchbricht die Dunkel-heit und schleudert Doji und dessen Bey Dark Wolf zu Boden. Als von oben Kristallstücke auf die Kämpfer fallen, zerbricht die Maske von Phoenix.
sondern vor ihm weggelaufen ist, glaubt Doji das Recht zu haben, Yu an Ryuga auszuliefern. Kenta und Hyoma eilen ihrem Freund zu Hilfe, sind aber gegen Dojis Attacken machtlos. Als dieser sie mit seinem Bey Dark Wolf besiegt hat, will er ihre Beys Sagittario und Aries Ryuga ebenfalls als Futter vorwerfenDoji nimmt Yu mit einer Schar Elite- Bladern gefangen. Da Yu Reiji nicht besiegt hat,
zu entkommenTsubasas Eagle weicht den Attacken von Ryugas L-Drago zunächst geschickt aus, und es scheint, als wolle sich Tsubasa auf einen Ausdauerkampf einlassen. Er wartet jedoch nur Ryugas Dark Move ab, um im richtigen Moment in die Luft zu schnellen und dem Zugriff von L-Drago Im letzten Kampf des Viertelfinales von "Battle Blader" tritt Tsubasa gegen Ryuga an.
Gingka und seinen Freunden, was er bei Doji erlebt hat. Kenta will ihn bei Reiji rächen, und dazu hat er gleich Gelegenheit, denn die beiden bestreiten die dritte Partie im Viertelfinale. Yu warnt Kenta vor Poison Serpent und gibt Kenta den zerstörten Bey Libra in die Hand.Yu, der schwer angeschlagen der "Dark Nebula"-Organisation entkommen ist, erzählt
Ryutaro antreten. Benkei setzt alles daran, um seinem Idol Kyoya zu imponieren, und es gelingt ihm sogar fast, ihn zu besiegen. Trotz seiner Niederlage ist Benkei glücklich, weil Kyoya erneut gegen ihn kämpfen will und ihm endlich Respekt zeigt.Protest muss Kyoya gegen Benkei und Gingka gegen Doji hat im Viertelfinale die Paarungen neu zusammengestellt: Nach anfänglichem
vorgehen sollen, räumt Doji in den eigenen Reihen Während Gingka und seine Freunde noch beratschlagen, wie sie bei "Battle Blader" weiter brutal auf: Alle, die bei dem Turnier verloren haben, müssen in der eigenen Arena gegen Ryugas L-Drago antreten, der die schwächeren Beys der Reihe nach gnadenlos zerstört.
Im fünften Turnierkampf der ersten Runde von "Battle Blader" hat Kyoya mit Kumasuke kein Problem. Er gewinnt auf Anhieb. Ebenso geht es Tsubasa mit Dan Sodo. Während sich Gingka und seine Freunde über die Siege freuen, ist Doji eher erstaunt als frustriert. Er weiß, dass er die richtigen Trümpfe noch in der Hand hat. Als Ersten schickt er Reiji los, einen bislang unbekannten Blader, dessen Bey Serpent seinen Gegner offenbar mit Gift lähmt.
Paare, die gegeneinander antreten müssen, sind von besiegen, Watarigani unterliegt Kenta und Teru unter-liegt Ryutaro. In einem vierten Kampf tritt Gingka gegen Yu an. Beide kämpfen bis zum Äußersten. Doch mit der Unterstützung seiner Freunde gelingt es Gingka, Yu in einem langen Kampf zu besiegen.Doji bereits festgelegt: Benkei kann Captain Capri "Battle Blader" ist eröffnet und die
aussichtsloser Lage feuern diese Gingka noch an. Und das Erstaunliche ist, dass alle Moves, die Gingka von seinen Freunden kopiert hat, funktionieren.Tsubasa versucht dahinterzukommen, was Phoenix ihm mit Gingkas Freunden sagen will. Da Phoenix selbst Gingka zum Beykampf herausfordert, kann er ihn und seine Freunde genau beobachten. Auch in
50.000 Punkte zusammen. Als Gingka im Quartier der Kenta, Hikaru, Hyoma und Benkei haben ihre nötigen Freunde wieder eintrifft, hat er nur 48.000. Kenta schlägt vor, dass die Freunde untereinande kämpfen, so dass Gingka die nötigen Punkte von ihnen bekommt. Das lehnt Gingka aus Fairnessgründen ab. Madoka stellt fest, dass in einer Stadt noch ein Qualifikations- turnier stattfindet, bei dem Gingka die nötige Punkt-zahl holen könnte.
Kazuki und Yui, die wie die anderen Kinder und Bewohner unter der Tyrannei von Busujima leiden. Auf seinem Weg zum nächsten Turnier kommt Kenta in eine verlassene Stadt. Dort trifft er Dieser hat mit seiner Gang das dortige Stadion okkupiert, und den Kindern bleibt nichts anderes übrig, als auf einem Schrottplatz zu spielen.
Auf dem Dach der Zentrale von Dark Nebula kämpft Tsubasa gegen Ryuga. Auch wenn Ryugas L-Drago die größeren Kräfte freisetzt, kann sich Earth Eagle lange gegen ihn behaupten. Als er am Ende der Übermacht erlegen ist, taucht unvermutet Phoenix auf und rettet Tsubasa und Earth Eagle vor Dojis Zugriff.
Ryuga taucht mit seinem Bey L-Drago bei den Qualifikationsturnieren auf, um Punkte für die Qualifikation zu sammeln. Das gelingt ihm mit Leichtigkeit und er schlägt gute Gegner wie Tobio und Ryutaro auch im Zweierpack. Unterdessen nutzt Tsubasa eine Wartungspause von Merci, um im Kontrollraum hinter das Geheimnis von L-Drago zu kommen.
Punktekonto langsam wieder füllt, stößt er auf einen neuen, unbekannten Gegner: Teru, der mit seinem Bey Virgo Hikaru und ihren Bey Aquario geschlagen hat. Während des Kampfes erzählt Teru, wie er Blader geworden ist.einen Kampf nach dem anderen. Während sich sein Da Gingka noch einmal von vorne Punkte sammeln muss, bestreitet er unter Zeitdruck
verhindert, dass Gingka an "Battle Blader" teilnehmen kann, hofft er auf eine Karriere bei Dark Nebula. Er selbst will Gingkas Punktekonto für sich verwenden, um am Turnier teilnehmen zu können.Tetsuya Watarigani verkleidet sich wieder einmal, und als Mr. Krabbenkuchen gelingt es ihm, Gingkas Pointer zu entwenden. Dadurch, dass er
Gingka, Hyoma und Kyoya. Da Yu und Tsubasa beide gegen Gingka kämpfen wollen, beschließen sie, zuerst die Schwächeren gemeinsam aus der Arena zu kicken. In einem direkten Vergleich mit Tsubasa zieht Hyoma den Kürzeren und fliegt als Erster raus.Doji macht aus dem Finale des gleichzeitig gegeneinander an: Yu, Tsubasa, Kenta, "Battle Royal". Das heißt, alle Finalisten treten Qualifikationskampfes in Glintsville City einen